随后，美英便着手筹建相应的组织机构。在美英军政府监督下，成立了美英两个占区的执行委员会，负责执行双方联合的政策。执行委员会实质上相当于高级行政部门，为了掩人耳目，它分设在若干个城市，负责经济事务的设在明登，负责粮食和农业的设在斯图加特，负责交通运输的设在比勒费尔德，负责邮电、民政和金融的设在法兰克福。1947年5月29日，美英签订关于改组双占区经济机构的协定，增设经济委员会，其总部设在法兰克福。原先的执行委员会隶属经济委员会，执行经济委员会的决定，并向经济委员会提供建议。此外，经济委员会还拥有某些立法权。
双占区成立与改组时，美苏两国在欧洲的关系已全面破裂。美国总统杜鲁门继丘吉尔发表“铁幕”演说之后，在1947年3月12日发表致国会咨文，提出战后美国对外政策纲领，即“杜鲁门主义”。杜鲁门要求国会拨款4亿美元援助希腊和土耳其政府。7月12日，美国与土耳其政府签订《关于援助土耳其的协定》，利用提供1亿美元的援助，从土耳其取得提供海、空军基地的回报。7月，美国军事经济代表团到达希腊;11月成立了美希联合总参谋部，并向希腊派驻军事人员18，000名。美国从此得以控制东地中海，实行对苏联的“遏制”政策。与此同时，美国新任国务卿马歇尔于6月5日在哈佛大学的讲话中提出了《援助欧洲复兴方案》，即“马歇尔计划”。12月19日，杜鲁门向国会提出“美国支持欧洲复兴计划”咨文，要求国会在1948至1952年拨款170亿美元。国会于1948年4月2日通过“1948年对外国援助法”。“马歇尔计划”正式被执行，其目的在于保持一个在美国控制下繁荣而稳定的西欧，以便“遏制”苏联和实现美国的世界霸权。
“杜鲁门主义”与“马歇尔计划”的提出，宣告美国正式向苏联发动冷战。在这种情况下，美苏在德国问题上陷于僵局，致使1947年底召开的第5届伦敦外长会议以失败告终。
在伦敦外长会议上，美法之间逐步弥合了分歧。会前，美国已向法国作出两项让步，一是向法国提供2亿5千万美元贷款，二是在1947年10月5日宣布萨尔经济区并入法国，并建立自治政府。会议期间，美国集中精力拉拢法国，于12月4日宣布通过萨尔宪法，以法律形式保证萨尔并入法国。美国的让步促使法国改变在德国问题上的立场，考虑法占区与美、英占区合并。
伦敦外长会议后，美国决定从政治经济上进一步分裂德国，只是要等待形势的发展。1948年初捷克斯洛伐克爆发“二月事件”，以哥特瓦尔德为首的捷克共产党推翻资产阶级联合政府，掌握了政权。欧洲冷战气氛从此益浓。美国大肆渲染“苏联和共产主义的威胁”，并以此为借口，大力加速德国分裂步伐。1948年2月23日至6月初，美、英、法拉拢荷兰、比利时、卢森堡在伦敦召开了6国外长会议。会议结束时发表了“伦敦建议”，就建立司法、立法、行政三权分立的西德政府的雏形提出一整套设想。立法机构由两院组成，上院由各州派等额代表参加，下院按州人口比例选举代表参加。两院拥有同等的立法权，但拨款权在下院，任命权在上院。政府首脑由两院选举产生，联邦政府下设的地方政府拥有教育、卫生、福利、警察、宗教与文化等事务的权力。“伦敦建议”还规定设立最高法院，调解中央与地方政府的纠纷，保护地方权力不受中央政府侵犯。最高法院有权建立完整的司法制度。为了尽早成立西德政府，6国代表建议美、英、法军事长官召集西方占区州总理开会，授权他们举行制宪会议，制定宪法，时间不迟于9月1日。
