解放军进藏时，印军在中印边界东段已造成了控制地区以“麦线”为分界的既成事实，对此，中华人民共和国政府在50年代后期就中印边界问题表明了自己的原则立场，即认为两国之间存在着一条传统习惯线，同时承认中印边界问题是历史遗留下来的未决问题。中国政府对于印度单方面划出边界线并强加于中国的做法虽然不能同意，但是从维护中印友好的大局出发，中国方面仍主张，对中印两国在边界问题上的分歧应以双方友好的根本利益为重，应采取互谅互让的态度，考虑到历史背景和当前的实际情况，根据和平共处五项原则，有准备有步骤地通过友好协商，全面地加以解决。以此之前，作为临时措施，双方应维护边界现状，不在边界上采取片面行动，更不应以武力改变边界状况。
进入50年代后期，印度政府在对华关系上的两面政策显得更为突出，即一方面支持恢复中华人民共和国在联合国的合法席位，一方面却又暗中支持西藏分裂主义分子的活动。1958年，印度政府又以外交方式在中印边界西段向中国提出领土要求。因中印边界西段的阿克赛钦地区从未被印度管辖过，1951年中国人民解放军进驻了这一地区后，印方在六年间都不知道。后来印度政府承认，直至1958年7月号的《人民画报》上刊登了新藏公路通车的消息，印方才知道中国军队进驻了这一地区。同年8月21日，印度政府就中国出版的《人民画报》刊登新藏公路通车消息一事向中国驻印大使馆提出抗议。同年10月，印度军队的一支15人的巡逻队在驮运给养的骡马伴随下，通过克什米尔东北部荒无人迹的高山地区，第一次进入阿克赛钦地区进行侦察，当即被中国边防人员扣留, 随后又被解送出境。同年10月印度政府又就中国修筑的新藏公路“通过了印度国土”和巡逻队被扣的问题，无理地向中国提出抗议，当即被中国政府拒绝。中印边界西段的领土争执，就此成为两国领土争端的一个焦点。
1959年3月西藏上层反动分子公开发动全面武装叛乱，印度领导人当即在公开场合一再表示“同情”叛乱分子。印度国内也掀起一股反华逆流。4月间达赖出逃印度，印度官方竟以高规格接纳，尼赫鲁并接见了达赖，后来甚至允许其在印度的达兰萨拉成立了所谓“西藏流亡政府”。中国政府在忍无可忍的情况下，对此理所当然地做出了反应。从1959年4月起，《人民日报》上曾登载了一系列文章，公开对印度的反华言论进行了批驳。但是从当时中国的外交政策和整个战略需要出发，中国政府对印方的不友好行为仍采取了十分克制的态度。当时美国是中国最主要的对手，并在朝鲜半岛、台湾海峡和印度支那三个方向对中国形成“三管齐下”的战略威胁。中国的战略重点一直在东部，并不想在西部分散注意力。
