如此，最后约有2600名官兵被编入阎锡山部队，另有技术人员和家属，共约6000余人。阎锡山对所留用的日本士兵发双饷，并一律晋升为少尉或中尉。
对阎锡山擅自留用日军战俘一事，蒋介石相当恼怒。1946年1月20日，蒋在日记中写道：“阎利用日俘，不能遵令解除其武装，乃为匪部藉口，甚不争气也。”3月28日，蒋再次谴责说，“阎锡山仍利用日寇编入其部队，一面谎报已完全缴械，近竟为共匪发觉，捕获其队内之日兵，乃向执行组提出抗议，殊为我军最大之污点，阎之卑劣不仅丧失其个人人格，而且丧失我国格矣，可痛。”
当天，蒋还让阎的老部下、军令部部长徐永昌去做阎的工作，称：“山西有利用日俘对共作战之事实，此种情事实属破坏国家政策，教敌人看不起，无论对内对外使主席不能负责（不但共党宣布，日人亦有正式报告，美方亦不谅解）。”
