“雷神”验证机在机体中线位置安装了一台“阿杜尔”MK951型涡扇发动机(欧洲六国联合研制的“神经元”验证机也是采用“阿杜尔”MK951型发动机)。在“雷神”验证机早期设计阶段，该机曾考虑过采用EJ200型涡扇发动机，经过细致的论证，BAE系统公司放弃采用EJ200发动机，原因是该发动机的尺寸过大，若运用于验证机，验证机机体尺寸就必须增大10%左右，这有可能导致该机的雷达反射截面积增大近20%。“阿杜尔”MK951型的涵道比为0.8，发动机的最大推力为29千牛，该型发动机是一型优秀的中等推力发动机，已经被T-45、“鹰”式教练机等飞机采用。据悉，最终定型的“雷神”无人机会采用推力更大，综合性能更好的发动机，“阿杜尔”MK951型发动机只是一个过渡。进气口设置在机体上方，进气口形状为三角形，进气道应该采用了前缘曲度较大的S型进气道，尾喷管则采用了异性遮蔽式固定喷管。
“雷神”验证机采用了数字式飞行控制系统，无尾飞翼布局的静不安定性突出，数字式电传操作系统结合对控制面的耦合控制，保证飞机三轴稳定和控制的能力。BAE系统公司此前在“渡鸦”验证机试验了电传操作系统，解决了电传操作系统的诸多关键问题。在研制“渡鸦”验证机时，设计人员尝试了多种操纵面，从“雷神”验证机图片来看，该机也采用了机翼上的可收放操纵面，其能根据控制指令实现差动，提供偏航力矩，此外，验证机起飞降落时放下的起落架舱门可以起到垂尾的功能，提高低速飞行时航向的稳定性。根据媒体报道，“雷神”验证机的想象图中的机翼上方出现了黑色圆孔，这表示“雷神”验证机可能试验射流推力矢量(FTV)和循环控制(CC)等技术，英国科研人员已经在“恶魔”验证机上试验了射流推力矢量技术，通过射流来获得飞机的俯仰和滚转控制力，这样飞机就可以取消襟翼和副翼等设计，有利于进一步提高飞机的隐身能力。
自主导航与控制系统是隐身无人作战飞机的关键组成部分，“雷神”验证机配备了惯性导航系统、全球定位系统、数字地图等组成的导航控制系统。这套系统能够自主控制无人机滑行、起飞，然后朝着预定目标空域飞行，在飞行过程中能够对飞行区域的威胁或意外情况做出反应。根据飞行器研制定型规律，首架“雷神”验证机可能没有装备了火控系统，据介绍，BAE系统公司为“雷神”验证机研制的火控系统包括雷达和光电传感器等搜索装置，无人机在进入目标区域后，利用机载搜索装置和数据链将目标信息传输给操作员，获得授权后无人机将自主攻击目标。
