这次刺杀得到了多米尼加共和国总统特鲁希略的大力支持。按照精心拟定的计划，近1000名古巴流亡者和雇佣兵将从多米尼加的基地出发，分批空运至埃斯坎布雷山脚下的特立尼达镇，然后由摩根做向导，一路杀进哈瓦那并干掉卡斯特罗，继而控制整个古巴。
1959年8月13日夜，首批人马抵达特立尼达镇。他们刚要高呼“卡斯特罗必死”，却惊恐地发现卡斯特罗已率兵恭候多时。经过短暂的交火，两名潜入者毙命，余者举手投降。
原来，巴蒂斯塔残部陷入了“引蛇出洞”的圈套——摩根是假意答应协助谋害卡斯特罗的。一转头，他就把对方的全部安排告诉了后者，两人将计就计，摧毁了这场图谋。
经此一役，卡斯特罗对摩根感激不尽，答应接纳他为古巴公民，摩根则称卡斯特罗为“忠实的朋友”。在新政权的大力宣传下，这位“美国指挥官”的传奇家喻户晓，在街头巷尾，情绪激动的民众争相和他握手，还有音乐家把他的事迹写成歌曲，广为传唱。
在此期间，华盛顿也在冷眼观瞧古巴发生的一切，对该国的政治走向日趋不安。巴蒂斯塔筹划刺杀卡斯特罗前后，CIA也曾派人与摩根接触，对其进行考察，希望他充当美国的情报渠道。然而，当摩根上演“无间道”，并与卡斯特罗“称兄道弟”的消息传来，美国方面觉得受了欺骗，大为光火。于是，在1959年9月，美国国务院取消了摩根的公民身份。
被控“谋反”，埋骨异乡
功成名就的摩根并未在重组的古巴政府中出任要职，自称“不是政治家那块料”的他躲进农场，亲手养殖牛蛙，为的是实现革命期间许下的、改善民众生活的承诺。
但是，摩根并没有完全沉醉在恬静的个人世界中，他注意到，以格瓦拉和劳尔为代表的”激进派”的影响力正在逐渐扩大。对此心怀不满的摩根开始出言抱怨，对新政权的“左倾”趋势严加抨击，令部分掌权者对这个“美国佬”疑心日重。
同样是出于对新政权的不满，某些“第二阵线”的成员重返山区，欲拿起武器与之对抗。1960年秋，摩根开始偷偷为他们运送武器。与此同时，在古巴流亡者游说下，美国情报机关蠢蠢欲动，针对古巴政权与卡斯特罗等人的新一轮密谋正在发酵……
1960年10月19日，摩根突然接到通知，要他去“农业改革研究所”开会，从此便“人间蒸发”了。遭到秘密逮捕的还有他在“第二阵线”的战友赫苏斯·卡雷拉斯，很快，两人被指控犯下谋反和叛国罪。尽管摩根在审讯中坚称自己一直在捍卫革命，古巴反间谍部门认定，他受CIA指使，企图“在埃斯坎布雷山区组织反革命团伙”。
1961年3月11日深夜，卡雷拉斯被率先枪决;5分钟后，摩根走向了刑场。
此后一个多月，肯尼迪政府发动了旨在推翻古巴政权的“猪湾入侵”，大败而归。不久，卡斯特罗公开宣布，古巴“开始实行社会主义革命”。这个历经动荡的加勒比海岛国同苏东集团的关系迅即升温，在漫长的冷战岁月中，扮演起社会主义阵营位于西半球的前哨。
就像当初在短短几年间成为“革命英雄”那样，威廉·亚历山大·摩根这个名字，以更快的速度在公众视野中消失了。历经牢狱之灾，他的遗孀奥尔加于上世纪90年代移居美国，为恢复摩根的美国国籍而奔走呼号。2007年，她终于收到了来自国务院的道歉信。
半个世纪过去，古巴政府依然对摩根之死保持沉默，不肯透露他葬身何地。这也成为奥尔加的心结，她说：“我不能放弃，必要时，我一定会重返古巴，接他的遗骨回家。”
