塞瓦斯托波尔的地位也是一个至关重要的问题。塞瓦斯托波尔位于克里米亚半岛，但在苏联时期一直是个直属于中央政府的直辖市(地区)，在历史上克里米亚与俄罗斯的分分合合中，塞瓦斯托波尔的地位并没有明确的法律规定。苏联解体后，塞瓦斯托波尔成了俄乌之间最大的争议问题，俄方不得不向乌方缴纳数量庞大的费用来保留黑海舰队在那里的驻扎地位。在目前克里米亚申请加入俄罗斯的进程中，塞瓦斯托波尔并没有作为一个独立的问题提出来。但对于普京和俄罗斯政府来说，塞瓦斯托波尔依然是个“直辖市”。因此，普京在讲话中强调：“克里米亚和塞瓦斯托波尔都应成为俄罗斯的主体。” 根据普京的讲话，新的克里米亚共和国显然不会包括塞瓦斯托波尔。塞瓦斯托波尔可能获得隶属于中央政府的“直辖市”或者某种“特区”的名称，按照俄罗斯当今通用的说法是：“全联邦意义的城市”。
克里米亚入俄后，其政府组成和领导人的任命将在很大程度上与莫斯科的意志紧密相连。也就是说，它在内部事务上将更多、更强烈地依靠中央政府。按照现行的做法，普京要往各联邦区以及相关的主体派驻总统全权代表，因此普京往克里米亚派驻全权代表的可能性极大。
俄罗斯的军队将驻防克里米亚，不仅会布防重要的军事重地，而且会设置和建立一系列军事基地，尤其是海军基地。由于东南西三面环黑海，克里米亚将重新成为俄罗斯通向世界海洋之路的前哨阵地和保卫俄罗斯南部疆域无可替代的堡垒。
