对解放军来说，这样的失败同样十分罕见。很快，指挥金门战役的解放军第三野战军第十兵团司令员叶飞就收到了第三野战军的批评：“查此次损失，为解放战争以来之最大者。其主要原因，为轻敌与急躁所致。”同时还要求“将此次经验教训深加检讨”。
几十年后，叶飞回忆起这场败仗时说：“世上事物，有利有弊，坏事能变好事。我1949年未能打下金门，不可原谅。但留着金门看来也有用场，否则，1958年不就少了一台大戏唱嘛!”
但是，金门战役的影响却是深远的，它使解放军对登陆战的艰巨有了深刻认识，不敢再像过去那样单靠陆军发起登陆作战，从而阻止了解放军进军台湾的脚步，间接导致了台湾问题的产生。因此，当国民党获胜的消息传到台北，蒋介石流着泪说：“这一仗我们全胜了……台湾安全了。”蒋经国也认为：“金门登陆共军之歼灭，为年来之第一次大胜利，此真转败为胜、反攻复国之'转折点'也。甚愿上帝佑我中华，使我政府从此重振旗鼓，得以转危为安，转祸为福，幸甚幸甚。”作为参战主力的胡琏则说：“金门战役的胜利既是军事上的，也是政治上的，更是精神上的。”
金门之役结束后，胡琏的第十二兵团奉命就地改为金门防卫司令部，胡琏担任司令。虽然金门古有“仙洲”之称，听起来好像是陶渊明笔下的桃花源。但是在胡琏的眼中，金门却远非如此。他后来在回忆录中写道：“每当笔者伫立在北太武山顶环顾四野，便觉杀气腾腾，上冲云霄。'料敌从宽'，古有明训，而且一定要计算到敌必来攻。金门孤悬海上，并没有盘弓弯马的余地，一场大战，必然是硬碰硬的重量级拳击赛。因此便想到了一句江湖术语：'能打不如能挨!'”
国民党军队驻守金门期间，人称“金门王”的胡琏持之以恒地干着一件事，那就是：深挖洞、广积粮、多藏弹药。胡琏每日开山不止，在“八二三炮战”前，金门已经构筑了比较完整的环岛防御体系，各种坑道纵横交错，有外国记者把掏空的金门称做是“一块布满窟窿的瑞士奶酪”。“'国军'最精锐的部队猫在山洞里把望远镜对准只有一个步枪射程之遥的大陆。防止伞兵降落的铁钉遍布全岛。在所有可能登陆的海滩，精心安放了一层层用水泥桩、铁丝网、深壕构置的鹿砦。
埋设的地雷像天上的繁星无以计数，以致时常有人畜挨炸的事件发生。伪装过的密密麻麻的碉堡封锁着港湾和公路交叉路口。仔细观察，茂密的树丛间伸挺着黑洞洞的坦克炮、榴弹炮炮口。纵横交错的地下道路和隧道通向营房、炮台、哨位、饭店、医院，甚至一家电影院。数万全副武装的军人像地老鼠一样长年在炸开坚石修建的地下工事里生活和工作。
