天启三年由司礼秉笔监提督东厂，车马仪卫，与熹宗一样。东厂设于明成祖时，用以缉察官民，由司礼监秉笔太监提领，直属于皇帝。司礼监秉笔太监是皇帝身边最亲近的人，要代皇帝阅批大臣奏章，魏忠贤大字不识几个，本不应充任此职。同党田尔耕掌厂卫事，许显纯为镇抚司理刑，每日罗织罪名屠害忠良，呼号敲扑的刑杖声日夜不绝东林党人左副都御史杨涟弹劾魏忠贤二十四大罪。说：“宫中、府中，大事、小事，无一不是忠贤专擅。”“皇上为名，忠贤为实。”百官响应，弹劾魏忠贤的呼声一时甚嚣尘上。魏忠贤惧，求韩爌调解，韩爌不理。魏忠贤泣诉御前，并托客氏从旁洗饰。熹宗令魏广微拟旨切责杨涟。魏忠贤佯装辞去东厂职务，自愿出宫避祸，熹宗再三慰谕，为此接连三日辍朝。
第四天有旨传下，敕诸臣不得擅出奏事。朝臣大愤，罢朝以后，各去缮备奏章，陆续上陈，先后纠劾魏忠贤的不下百余疏，或单衔，或联名，皆义愤填膺。陈道亨调任南京兵部尚书，已称病归隐，不参与公事，此时也忿然联合南京部院九卿诸大臣上书。大学士叶向高及礼部尚书翁正春，请将魏忠贤遣归私第，以聊塞众谤，熹宗仍然不从。工部郎中万某，实在看不过去，便上言：“内廷外朝，只知魏忠贤，不知陛下，岂可尚留左右。”魏忠贤正愤无所发，见了此疏大怒，随即传出矫旨，廷杖万某百下，一班走狗都跑到万某寓中，你一拳，我一脚，边牵边殴，待牵到阙下，气绝而亡。
