1938年10月30日，汪精卫决定与日本议和，但对于是否要逃离重庆还在犹豫之中。11月26日上午，梅思平将与日方签订的重光堂《日华协议记录》等带回重庆，由陈璧君收藏。在此期间，汪精卫召集周佛海等人讨论投敌的事，一连开了七八次会，顾虑重重。一些资料显示：“那几天，每天晚餐后，汪精卫总是在上清寺公馆的院子里踱来踱去，一言不发，一个人陷入穷思极想的苦海中。陈璧君特意关照周围的人不要打扰汪精卫，说，干与不干，要由他自己决定。”
11月底，梅思平要去香港给日方答复，汪精卫设家宴为梅饯行。临送梅出客厅门口时，陈璧君厉声对汪精卫说：“梅先生明天要走了，这次你要打定主意，不可反悔!”汪精卫看了陈璧君一眼，连连点头说：“决定了，决定了。”
汪精卫集团出逃后，蒋介石动员各方力量劝阻，希望汪精卫回心转意。曾与汪精卫夫妇留法并有过较长时间交往的国民党元老吴稚晖，深知陈璧君的为人。他认为汪精卫的叛逃，陈璧君一定起了关键的作用，因陈璧君“向有女中豪杰之风，能左右汪的意志”。他特别发了一封快信到河内，此信是写给陈璧君的。在这封信中，吴的言辞十分恳切，他以“病中所为”为汪氏夫妇的回头留下了台阶，但是，他一番恳切之词并没有使陈璧君回心转意，事实上，吴稚晖此信尚未到河内，汪精卫的“艳电”已经带到了香港。吴稚晖后来痛骂陈璧君为“陈屁裙”，认为汪的叛国，陈璧君要负相当重要的责任。
最后一个结束生命的汪伪汉奸
4月16日负责公审陈璧君的工作人员为：审判长孙鸿霖，检察官韦维清，首席推事石美瑜，推事陆家瑞，书记官秦道立。他们曾于4月6日与15日分别公审过陈公博和褚民谊。为陈璧君担任辩护律师的是曾为陈公博辩护过的长衫先生，老态龙钟的高溶。
审判长孙鸿霖按惯例询问被告年龄，籍贯，又问财产多少。陈璧君别转头说：“都已给政府没收了，你们应当比本人查得更清楚，还问什么?”口气中显得十分不耐烦。
对于陈璧君的坏脾气，参与侦讯和审判的人早有体会。
1945年10月14日，陈璧君及其长女汪文恂、次女汪文娣、外孙女何冰冰，还有褚民谊与原伪广东省府4个汉奸厅长一行9人，被宪兵押上一架美式军用飞机，解往南京。一到南京，陈璧君就被囚在宁海路25号军统看守所。陈璧君因有高血压，心脏病，提出要子女陪伴而住，以便照顾自己，还要求妹妹陈君慧和妹夫褚民谊住与她邻近的房间。看守所长徐文祺请示了上级后，同意了她的要求，让她与子女家人住二楼同一层。
在陈璧君的“指挥”下，二楼井然有序。大家按她的分配，轮流打扫房间和清理楼道卫生，个个老老实实。每天除在规定时间户外活动一下外，其余时间都在房里看书下棋。而陈璧君仍以“第一夫人”自居，总是呆在自己房里看书，静坐。陈的子女知道陈璧君脾气大，办事走路总是悄悄地不出声，生怕惹得她不高兴而大发脾气。
