1963年以后,由于中国军队在中印边界东西两段后撤,再度实行了脱离接触的隔离政策,两国军队直接接触的地段只限于中国和锡金边界。当时印军在锡金保持着2至3个旅的兵力,中锡边界上的印军一再向中国军队挑衅。1965年9月以前,在锡金同中国西藏边界上的乃堆拉山口等地,印军还占据了几个骑线制高点,所修筑的阵地有些延伸到中国一侧,对此中国方面一再提出抗议,印军却不肯撤回,并依托这些阵地经常向中国方向鸣枪或派出小分队骚扰。中国边防部队在不越过边界、不前推阵地的原则下了有限的回击。当时,印度政府将这些极为有限的接火大肆渲染,继续向美苏两国要求援助,中印之间的紧张局势实际上已成为其争取外援的一种手段,边境局势基本上还是稳定的。
1967年夏季,中国国内各地出现了大规模的武斗和冲击军事机关、抢夺武器的情况。在这种形势下,印度军方为对中国进行战略侦察,出动了2个旅的兵力(山地步兵第112旅和炮兵第17旅),于同年9月11日至14日在中锡边界的乃堆拉山口向中国方面发起攻击。驻西藏的人民解放军部队在内外受到严重压力,处境十分困难的情况下坚守阵地,对印军的进攻给予了坚决的回击。印军的攻击被粉碎后,根据中共中央军委的指示和以往的惯例,中国边防部队又通知印军派人前来中国境内,取回了遗弃的武器和几十具尸体。此后,印军未再向中国阵地发起攻击。
1968年,印度表示了同中国改善关系的愿望,此后中印双方军队在中锡边界(锡金当时还是印度的保护国,1975年被印度将其并吞为自己的一个“邦”)的武装冲突也随之停止。1976年中印两国恢复互派大使,随后两国的直接贸易和人员往来也逐步恢复。
1979年2月,印度外长瓦杰帕依访问了中国,邓小平在接见他时指出:“中印两国应该求同存异,世界问题可以通过友好协商,互谅互让,公平合理地一揽解决”。针对中印边界争端,邓小平根据毛泽东、周恩来当年确定的方针提出了“一揽子解决方案”,向瓦杰帕依提出:中国在东段让,印度在西段让。邓小平同时还表示说,话又说回来了,如果我们这一代人达不成协议,让下一代人解决。