在金门岛上，部分被俘解放军曾当即被补充进金门国民党军队。这是因为国民党军队虽然取得了全歼解放军3个多团的胜利，但也付出了沉重的代价———台湾军方声称，国民党军队共阵亡1269人，受伤1968人。但胡琏在1976年出版的《金门忆旧》一书透露：1953年初，金门守军为金门、大二担、南日岛三次战斗阵亡以及病死人员建造公墓，共收葬4500多具骸骨，而大二担、南日岛的战斗规模都很小，以此推算，金门国民党军队阵亡当在3000人以上。另据原国民党军队12兵团参战人员在回顾金门之战时称，12兵团的18、19军在金门之战中阵亡2546人，负伤3553人，合计损失6099人，其中118师阵亡598人，负伤2339人。综合这些数据，基本可以判定国民党军队在此战中阵亡3000人以上，负伤应在5000人左右，合计损失约9000至10000人，与解放军基本持平。这个数字是基本可信的，在金门之战中的解放军无论是单兵素质、作战经验还是战斗意志、战术使用均优于国民党军队，因此在战场形势极其不利的情况下，攻金解放军必定给予守军以重大杀伤。
