王德标率军入城，徐骧、林义成率义军埋伏在营地两侧。当晚，林义成率队出击敌军，放了一阵枪后，佯装败退入城。日军以为义军败退，便占据义军营地。半夜，王德标派一批勇敢、敏捷的战士，潜至营地附近，迅速将地雷药线点燃。轰然巨响，地雷连续爆炸。睡梦中的日军还未来得及弄清发生了什么事，便被炸死或炸伤。这一仗，日军死伤700多人。日军在溃退中，又遭义军伏击，死伤颇多。
十月叁日从日本本土出发，乃木希典中将指挥的第二师团(仙台师)从台湾最南端的屏东枋寮登陆，原订计划要打通南台湾，北上与第四旅团会合，但在打狗、凤山一带遭到游击队伏击，在进攻佳冬镇时也久攻不下，伤亡数百名士兵，战况陷入胶着。十月五日，日本近卫师团与客家残军在西螺爆发激战，徐骧战死。
十月九日，伏见宫贞爱亲王中将指挥的第四混成旅团，在联合舰队第一游击队浪速、吉野(东乡平八郎少将)的岸轰支援下，登陆嘉义布袋，成功威胁台南侧翼，但在盐水一带遭到黑旗军阻击，推进迟缓。
