1900年，日本趁着北京发生义和团事件，参与“八国联军”，更想藉机强占厦门，因而制造了一场“厦门事件”。
当年8月24日凌晨，位于厦门仔顶街的日本东本愿寺布教所发生火灾。事发后，后藤新平先抵厦门，日军计划8月28日从基隆港出发，后藤新平准备等30日军队一抵达，即以火警是清朝暴民所为为由，向清朝廷发出最后通牒，预估清朝廷会拒绝，日军将在隔天凌晨5时展开军事行动。
厦门事件一石二鸟
这事件事后被证实是由日本内阁总理大臣山县有朋、曾任台湾总督的陆军大臣桂太郎及儿玉源太郎、后藤新平4人设计，且获得了明治天皇的特许。
学者陈文添认为，儿玉源太郎除了想藉出兵厦门来“建立功名”，也认为清朝廷支离破裂，东北已被俄国占领，无力顾及南方;取得厦门是台湾往后向华南发展的根据地，也可根绝台湾“匪徒”逃亡厦门的管道。再者，台湾政治上虽“属”日本所有，经济上仍属于中国经济圈的一环，因此取得厦门是一石二鸟的策略。
