尽管习仲勋在工作中力避“左”的错误，但“左”的影响还是在全党弥漫开来。正在苦闷的时候，习仲勋接到了要他出席中共中央扩大会议的通知，更令他兴奋的是，这次会议的主题就是制定有关土地改革的方针政策。1947年12月25日至28日中共中央扩大会议在米脂县杨家沟举行，史称杨家沟会议。
习仲勋骑马日夜兼程从西北局所在地赶往杨家沟。根据会议安排，习仲勋参加了由任弼时主持的土改小组的讨论。会议期间，习仲勋实事求是地向毛泽东汇报了自己对边区土地改革中存在的问题和形势发展的看法。毛泽东非常专注地听取了习仲勋的汇报，这使习仲勋感受到党中央对实际工作存在的问题同样十分担忧，并希望得到实际情况后，予以纠正的决心。这种感觉使之前一直忧心忡忡的习仲勋心里轻松了许多。
果然，在28日进行的会议上，毛泽东在讲话中指出，“左”倾成为一种潮流的时候，共产党员要反对这种潮流。地主阶级作为整个阶级是要消灭的，但作为个人就要分别情况对待。随后会议作出的一系列指示和决定，更充分吸收了习仲勋等人的意见建议。党中央的及时制止，使土地改革运动“左”的偏向得到纠正。到1948年春夏，土改中“左”倾错误基本得到纠正。
在参加完中央扩大会议返回绥德义合西北局驻地后，习仲勋已经有了信心，因为心中有了党中央给予解决问题的“尚方宝剑”。因此习仲勋一回到西北局，虽然当时正逢元旦佳节，但他已无心和家人去享受节日的欢乐，立即带着工作来到绥德、米脂传达中共中央扩大会议精神，检查和指导边区的土改工作的开展。1948年1月19日，为了慎重对待党外人士，习仲勋与马明方联名向各分区发出通知，指出：在土改过程中，对参加三三制的党外人士，应慎重处理，县以上非党人士的处理，务必由地委提出意见，经西北局批准。县以下小学教师中的非党人士，须经地委批准后，才能处理。在习仲勋的努力下，此后再没发生严重的伤害非党人士的事情。在习仲勋的正确领导下，陕甘宁边区认真贯彻落实中共中央扩大会议精神，积极纠正会议召开之前在各地蔓延的“左”倾偏向，使边区土地改革运动沿着正确轨道开展起来。
1948年1月4日，即杨家沟会议结束后的第七天，习仲勋即以《关于陕甘宁边区老解放区的土地改革问题》为题致信西北局并转中共中央，就调查研究中发现绥属各县土地改革工作出现的问题，向中央作出汇报。
