另外，火控系统中还配有火炮重合射击装置，当火炮调到计算机计算出的瞄准角和方位前置角的位置时，该装置会自动输出允许射击讯号，如果此时炮长已经按下射击按钮，火炮会自动射击。由于该下反稳像式火控系统是炮长瞄准线在高低向和水平向都稳定的，因此99式坦克不仅能在静止时以较高的命中率射击固定和活动目标，而且还可以在行进间以较高的首发命中率射击固定和活动目标。为提高坦克的作战能力，火控系统中增加了车长对火控进行操作的功能。在99式坦克车长指挥塔前方，有一具可360度旋转观察的周视瞄准镜。该瞄准镜与炮长瞄准镜一样，均可在高低和水平方位上独立稳定，可独立稳定的搜索、选择和瞄准目标。车长可以进行目标指示，当炮长完成对一个目标射击后，车长可调转炮塔，使炮长捕捉车长选定的新目标射击。此后，车长可继续搜索新的目标。如果车长突然发现对己方威胁较大的目标时，可立即调转火炮和炮塔，当火炮瞄准线与车长瞄准线重合时，炮塔停止转动，这就实现了超越炮长调炮功能。如车长需了解炮长正在搜索的目标时，可按下连接炮长按钮，此时车长瞄准线与炮长瞄准线重合，车长镜停止转动，车长镜和炮长镜观察同一目标，从而实现炮长调炮车长配合功能。
主要装备有一门50倍口径的国产125毫米高膛压滑膛坦克炮，装备三种弹种，分别是尾翼稳定脱壳穿甲弹、破甲弹、榴弹，以及炮射导弹。弹药基数估计超过40发，该炮装有性能可靠的自动装弹机，火炮射速可达10发/分。99式坦克的自动装弹机仿自俄式坦克并在后期进行了改进，该系统由旋转输弹机、弹匣提升机、推弹机、药筒底壳抛出机构、火炮电机闭锁器、记忆装置、自动装填机配电盒、装弹操纵台、自动装填机操纵台、弹量指示器和全套电气系统安装组成。自动装弹机的装填角固定在4度30分，每发弹的装填时间为8秒。在自动装填方式时，9910式坦克的主炮射速为8发/分，采人工装填，射速降为1～2发/分。试验证明，该自动装填机的间隔故障率为千分之三。目前，更新型的性能优良、使用可靠、操作方便的装弹机系统已研发成功，将装备在99坦克上。发射尾翼稳定脱壳穿甲弹时初速为1760米/秒，直射距离 2300米，对均质装甲的穿甲厚度600毫米以上，发射破甲弹时初速1000米/秒。使用钨合金尾翼稳定脱壳穿甲弹时，可在2000米距离上击穿890毫米的均质装甲，而使用特种合金穿甲弹时，同距离穿甲能力达960毫米以上。该炮能发射中国仿制的俄125毫米口径炮射导弹，该导弹最大射程5.2公里，最大破甲深度700毫米。
在冷战期间，中国长期面对前苏联装甲洪流的强大压力，因此非常重视坦克炮和尾翼稳定脱壳穿甲弹的研究。加上改革开放后，对俄罗斯、西方火炮技术的引进吸收。99式主战坦克的125毫米火炮及配套穿甲弹，已经超越俄罗斯的125毫米坦克炮，与美国、德国同类产品处于同一水平。美国M1A2主战坦克在2000米距离上的穿甲能力为810毫米，德国的豹2a6主战坦克约为900毫米，日本的90式主战坦克为650毫米。
辅助武器：炮塔上右方12.7mm高射机枪一挺，备弹500发;火炮右侧有7.62mm并列机枪一挺，备弹2500发; 炮弹基数40发;炮塔两侧各有5个82MM烟幕弹发射器。
与西方主战坦克相比，国产坦克一般都忽略对辅助火力的精心配置。西方坦克的机枪一般装在环形枪架上，射界非常开阔，利于坦克对敌方迫近步兵的压制。而99式坦克的12.7毫米机枪是安装在固定枪座上，左右射界受到很大的限制。
由于人类社会城市化进程加剧，未来的地面战斗很可能在城市中打响，坦克的辅助火力也变得日益重要。西方各国相应推出了无人武器站，方便坦克乘员在车内控制机枪、自动榴弹发射器等辅助火力，而这类装备国内尚在起步阶段。遥控机枪技术目前在“倚天”防空系统中已经开始试行。
99式主战坦克装有车长与炮长独立观瞄装置与热像仪、激光测距系统，加上先进的计算机稳像式火控系统与导航系统，包括热成像仪、稳定式测距瞄准具、弹道计算机、车长控制面板、横风传感器、倾斜传感器、角速度传感器等。其炮塔左后方的组合式光电系统，包括有热成像仪和激光测距机，它的出现表明中国坦克的夜视夜瞄能力有了突破性的进展。探测距离号称可达7～9千米，恶劣气候条件下仍能达到3～4千米，行进间对2000米外目标的首发命中率达85%。火控系统的反应时间小于6秒。由于采用了先进的计算机稳像式火控系统，使得99式坦克具备了在行进中对活动目标的射击能力，首发命中率在90%以上。车长具有超越射击能力。
这些数据已达到西方第三代主战坦克的水准。此外，还采用了国际上先进而流行的猎-歼式火控系统(也称双指挥仪式)，其最显着的特点是，车长可以对火控系统进行超越(炮长的)控制，包括射击、跟踪目标和指示目标等;在坦克炮塔后部装有激光目眩压制干扰装置。最大作用距离4000米，“激光压制观瞄系统”，就目前来看，相对于西方主要国家的主战坦克，我们的这套系统的确可以称得上是独具特色，4000米内可让敌军坦克瞬间变成瞎子。夜战能力方面装有中国第二代凝视焦平面热成像仪，夜间或复杂气象条件下，对坦克目标观察距离达7--9公里，平均无故障时间为4000小时。在能见度只有100米左右的恶劣环境中对目标的发现距离为4000米，识别距离为3100米，具备了在昼/夜间于运动状态下对运动目标射击能力。
防护性能
99式主战坦克的炮塔没有采取铸造炮塔， 而是采取了全焊接 99G炮塔两侧的附加装甲装甲结构，这样的三代坦克通行的设计更能强化炮塔防护并能因应任务不同更换不同的复合或反应装甲模块，使得其装甲防护性能较老式中国坦克有了较大的提高。99式坦克加装了前部的楔形模块化装甲后，正面的防护达700毫米，车体防护能力相当于500～600毫米厚的均质钢装甲，如果在炮塔和车体上加装新型反应装甲后，抗穿甲弹和破甲弹的能力将会大幅度提高。众所周知，坦克最大着弹部位是炮塔，99式主战坦克在炮塔装甲上下了大工夫，其防护性能十分出众。99在正面防护弧度范围内安装了复合装甲，拥有极佳的抗弹性。炮塔前的复合装甲厚度600毫米左右，炮塔的其它部位则被栅栏及各种附加物所包围(这些东西对破甲弹有一定的防护力)。由于复合装甲为组合件，故可随着装甲技术的进步而更新。两侧和底盘正面可挂装披挂式的反应装甲。车内装有高效自动灭火/抑爆装置，可在10毫秒内熄灭火灾。99式坦克还可以加装中国已经研制成功的三代附加反应装甲，使得其防护力更加强大。除了装甲防护，99式主战坦克在炮塔两侧拥有10具烟幕弹发射器，可以发射可以存在一定时段不同类型的烟幕干扰迷惑敌方反坦克武器的侦察，并趁机快速脱离敌追踪。另外，将燃油喷入排气管，99式坦克可以制造也可持续4分钟长达400米的烟幕。
美国的M1A2车体和炮塔的装甲厚度相当于600毫米和700毫米的均质装甲，德国的豹2A6车体和炮塔的装甲厚度相当于580毫米和700毫米的均质装甲，日本的90式车体和炮塔的装甲厚度相当于500毫米和560毫米的均质装甲，由此看来，我们的ZTZ99主战坦克与西方坦克的防护水平基本上在同一层次上
结构及配置
ztz99式主战坦克，装有一门125毫米高膛压滑膛坦克炮，使用钨合金尾翼稳定脱壳穿甲弹时，可在2000米距离上击穿850毫米的均质装甲，而使用特种合金穿甲弹时，同距离穿甲能力达960毫米以上;
该炮还能发射中国仿制的俄125毫米口径炮射导弹，导弹最大射程5.2公里，最大破甲深度700毫米，辅助 武器：QCJ88式12.7毫米高射机枪一挺，(备弹500发);
7.62毫米并列机枪，一挺(备弹2500发); 炮弹基数40发;
火控系统，采用了国际上先进而流行的猎-歼式火控系统(也称双指挥仪式)。 99式的尾部
其最显着的特点是：车长可以对火控系统进行超越(炮长的)控制，包括射击、跟踪目标和指示目标等;在坦克炮塔后部装有激光目眩压制干扰装置。最大作用距离4000米，“激光压制观瞄系统”，就目前来看，相对于西方主要国家的主战坦克，我们的这套系统的确可以称得上是独具特色，夜战能力，装有热成像仪，夜间或复杂气象条件下，对坦克目标观察距离达2000米，具备了在昼/夜间于运动状态下对运动目标射击能力;坦克防护能力：炮塔可挂装多种复合反应装甲或反应装甲。车内装有高效自动灭火/抑爆装置，可在10毫秒内熄灭火灾;99式坦克目前采用了1200马力的涡轮增压中冷式大功率柴油机，最大公路时速达70公里/小时，0～32公里加速时间为12秒。最大行程为600公里。
性能数据
型号： ZTZ99 ZTZ99A
乘员： 3名 3名
全重： 51吨 52吨
发动机马力： 1200马力 1500马力
发动机： 150HB 150HB改进型号
最大公路时速： 67公里/小时 80公里/小时
最大越野时速： 56公里/小时 60公里/小时
作战行程： 450公里 600公里
主炮口径： 48倍125毫米滑膛炮 50倍125毫米滑膛炮
备弹： 41发 41发
同轴机枪： 86式7.62毫米机枪 86式7.62毫米机枪
车顶机枪： QJC88式高射机枪 QJC88式高射机枪
正面防护： 600毫米 800毫米
附带装甲： 爆炸反应装甲 双防反应装甲
观瞄装置： 激光压制观瞄系统 激光压制观瞄系统
火控系统： 猎-歼式火控系统 大闭环式火控系统
优点
125mm主炮在口径上较西方坦克有优势
独有激光观瞄压制系统(激光致盲)
新的反应装甲厚度比T-90主战坦克的接触反应装甲厚
车内空间比俄制战车大-自动装弹机(T-72的机械旋转弹盘)更安全，不易使乘员受伤.
缺点
99式火控系统在刚刚列装时属于较先进技术，但炮长观瞄镜头较小，另外火控设备精度仍要继续提高。
战斗全重较大，相对于中国的许多桥梁的承重能力，通过能力较差。不过随着桥梁和铁路建设的发展，这个缺陷长远将会逐步得到解决。
价格较贵，作为新型和第三代坦克，其单车价格自然较早期老式坦克昂贵。且因为是新坦克，以及军费引发的产能限制，他的产量目前不多，不过这符合解放军和中国军工一贯的“小步快跑”发展思路。
其他第三代主战坦克
在火力上，99式与M1A2基本相当，可能超过俄罗斯的T-90。火控系统方面，得益国内电子工业的进步，99式也达到M1A2的水平，超过T-90。但是M1A2升级至M1A2SEP后，在信息化方面仍强于99式，当然车载信息共享系统涉及到整个陆军、乃至三军作战体系的联网，进行单车比较并不适宜。
在防护方面，99式的防护力仍不如装备了贫铀装甲的M1A2 ;因为采用全焊接炮塔，安装了大厚度、大倾角的复合装甲及附加装甲，99式的炮塔正面防护优于T-90。在机动性能上，99式的功率重量比已超越M1A2，也优于T-90。但由于实际机动性能还要考虑传动系统、悬挂系统的表现，这两个系统一向是国产坦克的弱项，所以对99式的机动性能不宜估计过高。
总体上看，99式主战坦已跻身于国际上最出色的主战坦克行列，这毋庸置疑。
