主要武器有1门20毫米机炮，备弹570发.共有9个外挂架，两个翼尖挂架各可接1枚AIM-9L“响尾蛇”空对空导弹;两个外翼挂架可带空对地或空对空武器，包括AIM-7“麻雀”和AIM一9“响尾蛇”导弹;两个内翼挂架可带副油箱或空对地武器;位于发动机短舱下的两个接架可带“麻雀”导弹或马丁马丽埃塔公司的AN/ASQ一173激光跟踪器、攻击效果照相机和红外探测系统吊舱等;位于机身中心线的挂架可挂副油箱或武器。F/A一1BC和D型还可带先进中距空对空导弹和“幼畜”(又称小牛)空对地飞弹。
F/A-18的作战功能可以说是全面而均衡。虽说夺取制空权、空中掩护航母编队的能力，F/A-18A/B/C/D都不如F-14。然而，在对地面、海面的攻击能力方面，F/A-18则比F-14高出不少。所以，在与F-14搭档的期间，F/A-18的地位也同样举足轻重。
F/A-18C/D
F/A-18C还可带先进中距空对空导弹和“幼畜”空对地导弹。采用机载自卫干扰机、侦察设备、新的“空中通用救生系统”弹射座椅、新型机载计算机、飞行故障记录仪和监视系统等。C型于1986年作首次试飞，1987年9月开始交付。从1989年10月以后交付的C型，可携带供全天候夜间攻击飞行任务使用的设备，包括前视红外探测系统导航吊舱，新的平视显示器和飞行员夜视镜。从1991年1开始，F/A-18C开始使用F404-GE-402EPE增进性能型发动机，推力为7900公斤，比前一型增加700公斤。并且原来的AN/APG-65雷达换装成AN/APG-73雷达。共生产了398架。F/A-18D是C型机的双座型，仅有前舱对飞机具有飞行控制能力。它除了作为一种双座教练机外还用来作为一种双座夜间攻击机和“野鼬鼠”任务载机使用。位于后座的飞行员主要进行武器系统的操纵。它的武器控制系统与C型机相似。第一架飞机于1988年5月6日首飞，第1架生产型D型于1989年12月1日装备帕特森河的海军试验中心。第1架执行夜间攻击任务的D型机于1999年5月1日交付第121攻击战中队。共生产113架。
F/A-18E/F
F/A-18E/F是最新改型，E型为单座，F型双座。采用了隐身外形设计，包括原来的圆形进气道改为方形进气道，涂漆含有吸收雷达辐射的材料。改换更大推力的发动机，推力加力达9986公斤。前机身延长0.86米，翼展加宽1.31米，机翼翼面增大9.29平方米，因此翼载减小;水平尾翼也有所增大，后掠角减小;机翼前缘边条面积增大了34%;机翼及机身的改进令空气动力性能有极大改善。其主要特点是增大了航程、每侧机翼处增加1个外挂架，而且机翼内侧挂架的最大挂载能力提高到2400kg,增加了载弹量和提高了作战能力。其电子系统中约有90%与F/A-18C/D通用，雷达选用了AN/APG-73 (AN/APG-65的改型)。
