运-9采用前三点式起落架布局。为了适应我国草地、雪地和沙土地等简易跑道起降的要求，前起落架和主起落架可能进行了必要的改进，如改进液压刹车装置和使用低压轮胎。运-9的驾驶舱风挡布置也有所改进，其目的估计是为了使驾驶员在实施战术空降作业时仍然有非常出色的向下和向前视野，而且在地面机动过程中有利于提高驾驶员的注意力。
运-9采用全新设计的飞机外形及机体结构和飞行控制系统、货运系统，配置新型发动机和各种先进的国产设备，具有强大的空运空投空降能力，可一次空运重量不超过20吨的货柜或散装货物。
运-9运输机的玻璃化座舱
运-9的航电系统是该机的最大亮点之一。运-9继承了陕飞近十年来在军民两用航电设备上所取得的丰硕成果，该机的航电系统已达到国际上90年代中期的先进水平，主要表现在驾驶舱玻璃化以及座舱采用了多功能、模块化综合显示系统等。由于其航电系统的软件和数据接口采用了开放式模块化设计，未来可在原有设备基础上，迅速实现系统的性能提升。虽然为了保证在全天候气象条件下的飞行安全，该机采用了相对保守的四人驾驶体制，但是借助多功能显示和综合化数字式航电设备，驾驶员中的任何一人都能完成大部分飞行操作，减轻了驾驶员的工作负荷，有利于该机为完成复杂战术任务所进行的长航时飞行。
为了保证驾驶员有开阔的视场角，驾驶舱航电系统包括六部相同的大尺寸高清晰度主动矩阵液晶显示器。这些下显示器沿主仪表板安装，其中的两块可能作为多功能控制和显示装置（MCDU），为飞行工程师提供数据支持。对比美军C-130J-30型军用运输机和运-8F-600型飞机的驾驶舱航电系统，可以推测运-9型飞机的六部下显示器主要提供主飞行显示、导航和战术显示、发动机和燃油系统显示、舱内系统显示及电子战显示等五种格式的数据。正常工作情况下，主飞行显示器位于正、副驾驶员面前位置，用于显示飞机俯仰和滚转、航向、实际的和可能的航迹角、飞行航迹、选择的和实际的速度及高度、无线电高度等基本飞行参数。
