具有自主式攻击能力的JDAM制导炸弹，除可由作战飞机从低、中、高空实施水平轰炸外，还可实施俯冲和上仰轰炸;既可实施定轴轰炸，也可实施离轴轰炸;既可同时攻击多个目标，也可同时攻击单个目标的不同部位;既可攻击预定的固定目标，也可攻击飞机飞行过程中发现的新目标。其作战使用过程随飞机类型、攻击方式和瞄准原理的不同而异。由于在科索沃战争中，美军是以装备合成孔径雷达和全球定位辅助瞄准系统的B-2A隐身战略轰炸机来投弹的，因此这里以此为例子进行介绍。F/A-18C投射该型炸弹，在程序上应该还有很多共同之处，由于这是F/A-18C首次投射该型炸弹，故准确投放程序还有待以后研究。
B-2A采用了中/高空水平轰炸方式，对预先计划的地面固定目标或停放的静止目标实施轰炸的过程，可分为地面/空中准备、空中瞄准和攻击、飞机返航等阶段：
地面准备
地面准备分别由作战计划人员和地勤人员实施。包括任务计划、制导控制装置自检测、制导控制装置与战斗部的组装、制导炸弹的装机等。
作战计划人员使用任务计划软件，根据作战任务，确定飞行航线以及各主要航路点、4颗跟踪卫星以及备份卫星的序号、JDAM制导炸弹数量、投弹点位置以及投弹初始条件、命中目标时的参数(如命中角)，以确保获得最好的攻击效能。作战计划人员将任务计划内容通报作战飞行人员，并将制成的作战计划软件磁带装到飞机座舱上，从而将作战任务数据装入机载任务计算机。
地勤人员从弹药库将存放JDAM制导控制装置的包装箱运到外场装配站，采用专用检测仪器对其进行自检测，自检测时间约需5分钟;同时，将作战任务所需型号的炸弹弹体(如MK-83、BLU-109、MK-84、BLU-110)运到外场装配站，并将两者组装成为作战任务所需的JDAM制导炸弹，组装时间约需10分钟。然后，将该JDAM制导炸弹装到运弹车上，运到停机坪上的B-2A轰炸机机身下，采用挂弹车将其挂到机身左右两侧武器舱内的旋转式投射架上，每个投射架最多可挂8颗JDAM炸弹，挂弹时间约需6分钟。
空中准备
飞机挂载JDAM炸弹后，沿预定航线飞行。到达预定航路点时，通过机载MIL-STD-1760军械总线接口和炸弹上的投射电缆，将机载28伏直流电加到JDAM炸弹上，提供投弹前的空中准备和瞄准计算以及投弹操作所需的电源。接通电源之后，JDAM炸弹处于预热状态，再次进行自检测，然后通过机载悬挂物管理系统，将预先计划的任务数据传输到JDAM炸弹尾部制导控制部件的任务计算机中。
由于B-2A采用武器舱内挂方式，在投射之前JDAM炸弹不可能跟踪卫星，因此必须在装弹时将所需要的几类关键任务数据加载在炸弹上，以保证炸弹从飞机武器舱内投射之后，弹载GPS接收机能快速截获由机载GPS接收机跟踪的4颗卫星。在飞机的飞行中，飞行员还可以根据战场形势变化重新选定攻击目标。
空中瞄准和攻击
当飞机飞到预定的投弹准备距离时，机身下的武器舱门打开，投射架处于弹射投放准备状态;当飞机飞到发射位置时，将开始投射JDAM炸弹。炸弹与飞机安全分离后，一旦弹载GPS接收机截获到机载GPS接收机所跟踪的4颗选定卫星，炸弹便进入自主攻击预定目标阶段，各自沿预定弹道飞向各自目标或同一目标的不同部位。
飞机返航
一旦JDAM炸弹从武器舱内按预定顺序投放完毕，飞机立即关闭舱门并沿预定航线返航。为保证飞机飞行安全，必须采用应急投弃方式将仍留在舱内旋转式投射架上的炸弹投掉。在美国出动B-2A隐身战略轰炸机用JDAM制导炸弹攻击我驻南联盟大使馆后，新闻界曾报道投了5颗JDAM。但从B-2A的弹舱结构布局来看，二个弹舱并排位于机身正下方纵轴线的两侧，每个弹舱在其旋转式投射架上可最多悬挂8颗GBU-31，总共最多可挂16颗GBU-31。为保证飞机稳定飞行，所有炸弹都必须对称地悬挂在2个弹舱内，无论是投弹前、还是投弹后。因此B-2A是不可能带5颗GBU-31的，也不可能还留1颗GBU-31返航。因此该机至少带有6颗或6颗以上的偶数枚炸弹。这第六颗GBU-31要么已经钻到地下，而入口被建筑物破片掩盖;要么在返航时被抛弃到海底，成为危及过往舰船的定时炸弹。
美制JDAM使用4枚GPS卫星制导，而开发中的卫星制导炸弹需要同时配用北斗1号双星定位系统和差分式卫星定位系统。
负责投掷的战机需装设合成孔径雷达.以对目标实施精确瞄准定位。而目前解放军战机的机载合成孔径雷达不仅体积较大，且技术可靠性仍显不足。
