报道称，马英九本次出访专机将首度飞越俄罗斯领空，前往德国法兰克福过境加油。由于不必再绕南边航线，航程省下近3小时，但长达57小时的飞行时数，刷新马英九历次出访纪录。
据悉，这次台方以“商务专机”模式，成功向俄罗斯争取飞越其领空，事先已透过管道向中国大陆“打招呼”，但专机会往北飞，由日、韩两国之间穿过，抵达黑龙江、乌苏里江口的大城伯力。绕过大陆的防空识别区后，飞机再向左转，穿越整个俄罗斯上空，经由波罗的海进入德国。
至于由洛杉矶返台的回程，虽然会通过大陆防空识别区，但以往每次专机都是循此路径，因此不会改道，也不会向大陆提交飞行计划。
马英九将首次造访圣多美和普林西比，会晤总统、总理，也将参访台湾的援建及合作计划;之后前往布基纳法索仅停留5小时，接着飞往洪都拉斯参加新任总统就职典礼。
回程过境洛杉矶时，马英九会与美国政要会面或互通电话，也预定参访里根博物馆、中华会馆及马氏宗亲会，并参与侨宴。
