罗兴亚人的民族身份问题、国籍问题，遭到了缅甸许多政治团体、利益团体、佛教团体以及许多缅族普通百姓的强烈抵制，纷纷向政府施压，绝不容许政府通过人口普查变相接受罗兴亚人拥有缅甸国籍，迫于普遍反对的声浪，吴登盛总统最后不得不宣布，人口普查中，将不会出现罗兴亚人这个民族，而采用居住在缅甸的孟加拉国人的称谓来统计，而这种变更，也遭到了罗兴亚人的反抗，随后发生多起罗兴亚人在若开邦的一些镇区采取暴力手段攻击基层政府和警察局的事件，事后缅甸政府查明，这些煽动暴力攻击的行为得到了一些在若开邦的国际NGO组织的支持，导致缅甸政府做出了驱逐某些NGO组织和成员的报复性行动，同时，孟加拉国的一些媒体发文鼓励罗兴亚人搞独立公投使若开邦从缅甸独立出去的文章，更是招来缅甸民众的愤怒，一度前往孟加拉国驻缅甸大使馆举行大规模抗议。若开邦原本就有激烈的宗教冲突，而这次因为人口普查引发的新一轮骚乱，在此情况下，吴登盛总统宣布在若开邦恢复缅甸边防警察部队，以控制若开邦的局势。
缅甸边防警察部队原本是缅甸前总理钦钮在掌管军情局时创立的一支部队，在钦钮被清洗后，这只遍布全国各地的部队也作为钦钮的余孽而被裁减解散，但因为若开邦的复杂宗教局势和动乱，位于若开邦的这支边防警察部队还保留了一个军营和少量部队，原本要全部裁减，但因为民选后，若开邦的局势更加恶化，特别是从去年以来的多次骚乱，加上本次的发现一些国际NGO组织成为若开邦骚乱的背后支持者，促使了吴登盛总统决定恢复和重建这支部队。但由于这支部队在钦钮时期的无法无天的行为，缅甸军方对恢复边防警察部队以及受谁节制，是否会威胁到缅军一直主张的“一国一军”的政治主张，在民族地方武装都还没有被整编统一到缅军旗帜下来，现在吴登盛政府又打算恢复这支部队，而且非常显然，吴登盛总统并没有打算将这支部队归入缅甸国防军旗帜下，因此，缅军对吴登盛的这个总统令抱持着足够的警惕，至今都没有发表支持吴登盛总统恢复和重建边防警察部队的意见。
在人口普查中，除了罗兴亚人的问题外，还有涉及到众多民族的划分问题也成为一个非常突出的矛盾，也引发了许多民族地方武装的抗议和反对，而克钦独立组织、克伦等民族组织干脆就拒绝本次的人口普查，不允许联邦政府人口普查人员进入自己的辖区普查。缅甸政府为了突出缅族的主体民族地位，把缅族的各个支系甚至不属于缅族任何支系的民族，都采取强迫和“志愿”相结合的手段，划为同一个民族—缅族。而对于其他民族的各个支系，又打着民族平等的旗号，将本属于一个民族的不同支系单独划分为一个民族，许多大的民族如克伦族、掸族、克钦族、孟族、汉族等民族的许多支系单独划分为一个民族，来分化一些人口基数大的少数民族，就造成了缅甸这个国家里有了135个民族之多的奇葩。而且不排除这次人口普查中又冒出新的民族来的可能。民族的划分问题，也是缅甸国内政局动荡的一个潜在根源。
虽然这次人口普查存在众多问题，准备也不够充分，但以佤邦和四特等为首的一些民族地方政府，出于对国家发展和和平的长远利益考虑，还是表态积极支持这次全国人口普查，并在自己的辖区内进行全面动员，做好做通自己的干部和百姓的工作，并分别组团到首都内比都出席全国人口普查启动仪式，佤邦和四特的这种积极支持和配合全国人口普查的态度，也有效地缓解了2009年以来与联邦政府和缅军因为强制改编引发的长期紧张关系。
