1999年6月15日上午，朝海军1艘鱼雷艇和9艘警备艇越过“北方限界线”，并首先向前往阻止的韩军舰艇开火，韩舰随即还击。双方交火从8时25分左右开始持续16分钟左右，朝方一艘鱼雷艇被击沉，5艘警备艇受损，30余人死亡，数人受伤：韩方一艘侦察舰和4艘高速艇受损，7人受伤。
2002年6月29日8点54分左右，朝海军两艘警备艇从韩国延坪岛北方越过“北方限界线”，韩海军以快艇各两艘组成的编队驶往现场，多次以广播警告，但朝艇不予理睬，并于9时25分左右向韩舰首先开火，韩舰立即还击。双方交火持续18分钟左右，韩方4人死亡、1人失踪，22人受伤，1艘高速艇沉没：朝方1艘警备艇被击中起火，30余人伤亡。
2003年2月20日，朝军1架“米格-19”战斗机于当天上午10时03分在西部海域延平岛附近越过“北方限界线”，然后于10时05分返回北方。韩国空军随即派遣2架F-5E战斗机前往监视，稍后又派了4架F-5E战斗机前去增援。驻扎在仁川地区的韩国导弹防空部队也因此进入战备状态。
强化作战准备
第二次延坪海战后，朝韩军方均采取了措施积极强化作战准备，完善事件处理及作战预案。主要情况如下：
【朝军】
朝海军加强了海上机动训练，为一部分舰艇舰炮安装了防护罩，将原76/100毫米舰炮更换成122/130毫米大口径炮。130毫米炮经过改良射程由24千米延长至35千米，命中率更高。
