1895年12月即光绪二十一年十月，新任日本公使林董在写给代理外务大臣西园寺公望的报告中介绍说：“现今之皇后，皇太后之侄女也，虽深为皇太后所钟爱，但其容貌不扬，且其痘痕斑斑，不独不为皇帝所宠爱，且甚至为皇帝所厌恶。皇帝专宠于某贵妃，因此该贵妃为皇太后所恶。正值此时，皇太后闻说去年由于此贵妃之密奏，而将与其师有关之人任用为官，大为震怒，以违背本朝家法为理由，将其师扑杀于前些时候，且亲自执杖鞭笞贵妃，将其贬为贵人。此事自然招致皇帝对皇太后的反感。”
这里所说的“某贵妃”就是珍妃。珍妃和姐姐瑾妃，早年随伯父广州将军长善居住广州，与堂兄志锐、兄长志钧一起拜文廷式为师。光绪二十一年十月二十八日，从颐和园回到中南海仪銮殿的慈禧太后，以与太监勾结卖官鬻爵的罪名，对珍妃实施“褫衣廷杖”的责罚，也就是扒去衣服当众杖打。十月二十九日，慈禧太后在懿旨中声称：“本朝家法严明，凡在宫闱，从不准干预朝政。瑾妃、珍妃承侍掖廷，向称淑慎，……乃近来习尚浮华，屡有乞请之事。……瑾妃、珍妃均着降为贵人，以示薄惩而肃内政。”此后，慈禧太后还专门在遭贬的瑾贵人、珍贵人住处悬挂禁牌：“俟后妃嫔等如有不遵家法，在皇帝前干预国政，颠倒是非，着皇后严加访查，据实陈奏，从重惩办，决不宽贷。”
据光绪皇帝的师傅、军机大臣翁同龢在日记中记载，鲁伯阳、玉铭、宜麟、裕宽等人，先后通过贿赂宫内太监永禄、常泰、高万枝以及瑾妃、珍妃，向光绪皇帝请求职位。因此，光绪皇帝对于慈禧太后的这种处置方式并没有表示异议，而是表现得“极坦然”。十一月初二日，珍妃处太监高万枝被慈禧太后下旨处死。
鲁伯阳通过珍妃贿买苏松太道(相当于今天的上海市长)之事，曾经轰动一时。胡思敬在《国闻备乘》中介绍说：“鲁伯阳进四万金于珍妃，珍妃言于德宗，遂简放上海道。江督刘坤一知其事，伯阳莅任不一月，即劾罢之。”
关于光绪皇帝和隆裕太后与慈禧太后之间的母子婆媳关系，积极支持戊戌变法的户部左侍郎、总理衙门大臣张荫桓，在1898年10月16日发配新疆途中，曾不避嫌疑地对押解差官说：“皇上、皇后事太后皆甚勤，又甚苦，每见皆战栗。侍立时，或太后赐食，即甚饱亦必勉强食尽。近年来以皇上故，皇后朝觐多不允见，见亦无多问答语。自古君后之苦，未有如皇上皇后之甚者也。”
