邱毅指出，在没有任何意外下，蔡英文即将回任民进党主席，但麻烦也将跟着来。目前挡在蔡英文面前的就是“三座大山”：一是年底的“七合一”选战;二是党务改革与派系斗争;三是两岸关系与大陆政策。
邱毅指出，“七合一”选战，是蔡英文必须担负起完全政治责任的关键节点。接下来一段时间，蔡英文对学运分子的安排，很值得观察。“是吸纳还是与之切割，任其成立政团，各种走向都很可能改变绿营的生态。”对此，蓝绿阵营都在看。按照目前的形势，蔡英文已不否认林飞帆、陈为廷、魏扬都是她的“绿小兵”，这些人未来的动向将成为蔡英文难以回避的包袱。若这些人可以被民进党吸收，成为年底选战的重要棋子，那蔡英文就得分，但是目前形势是这些学生们自主意识很强，他们甚至已经有要成立独立政团的意思。若学生们被台联党吸收，那民进党势必要失分，蔡英文就面临巨大压力，苏贞昌就又有了反转的机会。
此外，在派系斗争上，蔡英文过去两年仅低调担任基金会董事长，对各种麻烦事可以不沾染、不过问，甚至主动回避。持续不沾锅的结果是，蔡英文持盈保泰，相对于处于火炉上的苏贞昌，蔡英文累积了丰沛的政治能量，使其声望远远超越了苏贞昌。邱毅指出，“那未来，蔡英文再也无法不沾染尘埃了，她做了党主席就必须摆平派系，为党募款”。
对两岸关系，蔡英文也必须说清楚讲明白，尤其是对服贸的态度，对“九二共识”的看法，对两岸协议监督条例的立场，对“两国论”、“台独党纲”的存废决策……上述令人想想都头痛的难题，她再也无法云淡风轻地喊些口号模糊以对，而需真枪实弹地面对应付。
