在父母都认为他还在苏黎世联邦高等工业大学读博士的时候，童哲偷偷选择回国，开始创办他心目中的“网络大学”——“万门大学”。2012年10月，童哲在人人网上注册了“万门大学”的公共主页，从自己熟悉的物理学科开始，陆续上传录制的视频公开课，并创立了“万门大学图书馆”，推荐各个学科的入门书单。
“万门大学”的中文名称音译自英文One-man University，意为“每一个人都是自己的大学”。“万门”指“每个人可以通过学习给自己打开千万扇门，通过学习拥有无数种发展和可能性。”面对这样一所不太像大学的“大学”，童哲并不讳言其山寨性，但是通过提供多学科的优质视频教育资源，让不管来自哪里的学生都能享受到免费大学教育，却是童哲和其团队踏踏实实在做的事情。
童哲还设计了“万门大学”的标志。由三条正态曲线、“实”字、盾牌形状三部分构成，其中三条正态曲线体现了一种理性的力量，中间的“实”字和哈佛大学校徽上的VERITAS(拉丁语“真实”的意思)一样，整体的盾牌形状则是沿用了国际惯例。
在国内50余所大学进行巡回演讲后，现在的“万门大学”已经开设了40余个院系的公共主页，推出了相应的推荐书单、经验分享、知识介绍和视频课程，近期内“万门大学”的专门网站也会上线运行。
“小伙伴们”的拉面情
“一顿拉面聊下来，我们仨就一起拼命到现在。这是靠钱吗?志同道合的伙伴，我本以为我找不到，但事实上是真的存在。谢谢这个世界，我该是怎样的一种幸运啊。”童哲曾在网上表达了对他的团队伙伴的感激之情。
2013年4月，童哲在一次大学见面会上遇到了刚刚回国的张明达和刘晓楠。一位是加拿大多伦多大学政治学硕士，一位是香港科技大学经济学硕士，虽然学习背景不同，但却志趣相投。一顿拉面后，决定合伙一起将“万门大学”一直做下去。目前，同样毕业于加拿大多伦多大学电子系的崔毅也加入了团队，在技术上为“万门大学”带来了支持。
