“察合台当木秃坚死时不在这个地方。他于毁坏八米俺的时候回来。成吉思汗不许人将这个年轻王子的死告诉察合台。诈称木秃坚因事他出。几天之后，成吉思汗和三子会食，故意对他们生气，责备他们不服从他的命令，说话时候，注视察合台。察合台恐惧，长跪自陈，宁死不愿违反父命。成吉思汗反反复复地用这样的话问他：'这是实情么，你不违背你所说的话么'?察合台喊道：'如果违背，我宁愿死去。'成吉思汗于是继续说，好吧!你的儿子木秃坚战死，我不许你诉苦。察合台听说，有如触电，但是用力制止眼泪，于饭后出去一泄心中的郁结。”
但是，花剌子模王子札阑丁免古比儿迪--已故算端摩诃末之子，当他的家族和人民遭遇重大灾难时候，脱身出走。他避入阿富汗山中的哥疾宁(按：即加兹尼)，在那里重建一军，他统率这支军队向在吐呼罗斯坦围攻瓦里安的蒙古军挑战，杀其千人。蒙古人于是派更多的兵马来攻他--志费尼说是三万人，术兹查尼说四万五千人--以失吉忽都忽为统帅。双方在巴鲁安附近展开激战。历时两天。第二天，失吉忽都忽欲使花剌子模人相信他有援兵继至，命每一骑兵于他的从马上面位置一个毡做的假人，而自后扶之。这个计策几乎成功。花剌子模人于次日清晨看见蒙古军人数似是增加了一倍，打算退兵，但是札阑丁督促军队再战，蒙古军在人数上处于明显的劣势，终于被包围。失吉忽都忽坚嘱部下永不要离开他的犛牛尾旗帜，即他的纛，然而即将受到包围，蒙古兵纷纷溃逃。装备较好的花剌子模骑队追赶他们至于山谷之中，蒙古军损失惨重。志费尼的记述(为《拉施特书》所采取，第80页)所给我们的印象，这可能是成吉思汗大军多时所没有遇到的最严重的失败。
成吉思汗听见这个大败的消息，表现十分坚强而有自制能力。他很镇定地说，失吉忽都忽惯于常胜，从来没有受到劣运的考验：“此后他应该比较谨慎。”他立即负起弥补这次失败的责任。经过巴鲁安战场附近，他命人把失吉忽都忽的布局说给他听，他从而批评了这些措施。然而札阑丁不敢等待蒙古大军的来到。成吉思汗引乒追逐他，结果在申河(按：即印度河)之上赶上了他，并在那里获得大捷(根据涅塞维，这是在1221年11月24日)。札阑丁凭着个人的勇气，在这个可纪念的日子里，曾一度击退成吉思汗所自将的蒙古中军，他策马全副武装跳入申河，在乱箭交射之下，他竟然幸运地横渡过河流。成吉思汗满心叹赏，不禁让诸子以札阑丁为榜样。但是他还是把落在他手中的札阑丁的诸子杀死。(札阑丁也表现得很残酷，例如在巴鲁安战役之后他命人将钉子刺入蒙古俘虏的耳朵)。蒙古人没有进兵印度追赶札阑丁。只是在次年，他们的一个支队，在札剌儿人将领八剌那颜指挥之下进兵申河的东岸直达木勒坛。在目前，成吉思汗先要惩罚由于巴鲁安战败而引起的在东伊兰的最近叛变。因此他歼灭了哥疾宁的人民，而蒙古将领野里知吉带于围攻很久之后，取下了叛变的也里(赫拉特)(1222年6月14日)，所有居民，也被杀尽，这场屠杀历时整整一个星期。
纵使是这样，实事求是的头脑和天生的统治意识，在成吉思汗身上是永远不会失去地位的。于屠杀居民，甚至伪装离去而忽然引兵回来，屠杀残余人口之后，蒙古人终于在这些没有被削为平地的城里任命一种州长，即达鲁花，以负责编制人口统计册，招募军队的附属人员，成立帝国通讯驿站，征收各种应向汗廷交纳的税款和贡物。中国旅行家丘长春曾于1221年看到伊犁河谷的阿力麻里地方的达鲁花制度的施行。在成吉思汗曾想完全变成为沙漠的东伊兰，当然需要更长的时间来设立这种制度。但是在河中，他老早就将一部分行政事宜委付给他的新来幕僚回回人马合某牙剌洼赤或者无宁说是委付给此人的儿子马思兀牙剌洼赤，达鲁花的制度不久就普遍建立起来了。
成吉思汗在兴都库什山南边的阿富汗地方逗留了一些时候。
