就这样，李琪和江青之间的矛盾愈演愈烈。江青对人一向采取又打又拉的两手策略，她一方面怒气冲冲地说：“李琪骄傲自大，眼里没有我。”另一方面又别有用心地向李琪攻击北京市委，妄图拉拢李琪为她所用。这种种，使李琪更加认清了江青的真面目，再也压抑不住对她的不满和厌恶，甚至在周围同志面前，也不掩饰自己的这种情绪。
1965年5月，江青以谈工作为名，把李琪叫到上海。但李琪去后，江青根本不露面，只让张春桥从中传话。李琪一怒之下，拂袖而归。他气愤地对人说，我这个人是宁折不弯，我这个宣传部长又不是专管文艺的，把我叫去，两个多礼拜不见，真是岂有此理！其后，江青又两次叫李琪到上海。1965年2月，李琪第三次去上海见过江青回京后，愤然提笔写信给彭真，控诉江青“像皇太后”，“比西太后还坏”，“主观武断、简单粗暴，像奴隶主对待奴隶一样地对待我”。
不久，他又对北京市委的一位常委说：“江青品质极为恶劣，作风霸道，不赞成她，不跟她走，一定会遭受打击、报复。北京市委一定会被改组。”还对妻子李莉说：“江青如此胡来，我总有坐牢、杀头的一天，你思想上要有准备。”他已经意识到这是一场殊死的斗争了。
