这一停就是三年多，2005年4月26日早上，“瓦良格”在大批拖轮的护航下，被缓缓地拖进了大连船舶重工第一工场于2003年建成的30万吨船坞，8月初，瓦良格以解放军标准海军灰的新涂装出现在30万吨级船坞泊船码头。12月，飞行甲板大部已经漆上黄色的底子。2009年4月27日早晨，瓦良格又在多艘拖轮的推动下离开了原来的泊位。进入了刚刚落成的大连船舶重工在香炉礁新建的第三工场30万吨级船坞。2009年5月底，舰艏的苏联海军航空兵徽章正在拆除，舷侧的俄文舰名瓦良格——“ВАРЯГ”也被铲去。
