《史记·王翦列传》系王翦“南征百越之君”一事于秦军平楚之后，而据《史记·秦始皇本纪》记载，王翦平楚，事在秦王政二十五年，说明这次军事行动，在始皇二十六年尽并天下之前，即已展开。不过，秦朝的军事行动，并没有仅仅局限于扫荡边界。在如此强大的军事实力面前，处于秦朝想要划出的边界以内的一少部分外围越人，应该很容易或被驱走，或者彻底服属，《淮南子》云秦朝出兵后“三年不解甲驰弩”，应是在边界靖定之后，仍以重兵固守，以防止越人卷土重来。正因为靖定边界，不会遇到太大阻碍，所以，约略与此同时，秦廷又选择重点地区，尝试展开进攻。这一突破口，选在了黔中郡的南界。
《淮南子》所说监禄为转饷而凿渠，即著名的史禄开凿灵渠一事。这条渠道，凿通湘江和漓水两支水系，连结南岭两侧的长江和珠江两大流域，而在岭北一侧，湘江正流经黔中郡界内。如果仅仅是靖定或固守南岭这道天然屏障，自然无需费力开凿跨越南岭的运渠，显而易见，秦军在这里已经突入岭南地区，不再仅仅满足于以“九疑之塞”为限。在接近灵渠南端处，建有一“秦城”。《舆地纪胜》引宋鲍同《桂林志》记云，此城乃“秦始皇二十三年筑以限越”1。谭其骧以为文中“二十三年”应为“二十五年”之讹2，当是。这可以进一步证实，在秦始皇二十五年的时候，王翦所率秦军确实已经跨越湘、漓分水岭，进入岭南地区。《淮南子》记述说这次南征，“与越人战”的主要作战对象，是“杀西呕君译吁宋”，此“西呕”又作“西瓯”3，是古越人在今广西境内的一个分支，其属地正北接秦黔中界域4，可见黔中郡正是这次秦军南下岭南的通道和前沿基地。
秦朝的黔中郡，本来包含有今湖南省大部分地区，但就在王翦率军南征百越的秦始皇二十五年这一年里，秦廷将黔中郡一分为二，《太平寰宇记》引甄烈《湘州记》记述说，当时是“分黔中以南之沙乡为长沙郡，以统湘川”。从黔中郡中分设长沙郡，正是基于当时的政治和军事背景，用以强化原黔中郡南部毗邻岭南区域的管理，保障其更好地发挥对岭南百越作战的桥头堡作用。
南北分置之后的黔中、长沙两郡，并没有持续太长时间。近年发现的里耶秦牍中提到有洞庭郡7，张家山汉墓竹简的秦朝文书中记有苍梧郡。据目前已经公布的里耶秦牍，前者见于记录的最早时间，为秦始皇二十七年二月;后者也是发生在秦始皇二十七年二月至二十八年两年期间的事情。洞庭和苍梧这两个郡，大致应当是在秦始皇二十七年二月以前，分别由黔中和长沙两郡更名而来。
