1949年6月南北劳动党合并后，当选为朝鲜劳动党中央政治委员会委员。1950年12月就任中朝联合司令部副政委(司令员兼政委是中国的彭德怀)，相当于人民军的总政委。
但是，面对朝鲜政局变换，金日成逐渐大权在握的情况，朴一禹却不知收敛，自封为从中国回国的朝鲜革命者的代表，拉帮结派，隐隐有与金日成分庭抗礼之势。
