JE-3C 1987年波音接受美军2.415亿美元改型计划合同。要求在美国与北约的E-3上加装AN/AYR-1电子支援测量系统，以发现来自敌/友机的电磁信号，为美国与北约改装的各一架试验机于1991年交付。
E-3在海湾战争的沙漠盾牌行动中，是最早投入部署的飞机之一。在战争期间，E-3执行了超过400项任务，记录下的执勤时间长达5000小时。在联军40次空战胜利中，E-3参与了其中38次。
实战经验证明E-3“望楼”能快速有效的对危机做出反应，并对全球军事行动进行支援。
1987年5月，美军的E-3开始实施“整体合同(ICON)”改进计划，这一计划也为北约的E-3所采用。计划中E-3将增加一套电子支援系统，用于进行被动电子监听。同时还有其他一些小的改进。
1989年美空军开始接收由波音公司实施“雷达系统改进计划”(RSIP)而进行升级的第一批7架E-3空中预警与控制系统机。RSIP升级增加了脉冲多普勒雷达的灵敏度和抗干扰能力，并安装了GPS/惯性导航系统，以改进定位精度。雷达操纵同志台也得到升级，换装了更强大的新型多处理器计算机，重编了雷达软件。从而改善了雷达的可维护性和未来的可扩展性。诺斯罗普·格鲁曼公司在此计划中负责雷达计算机、雷达控制维护面板、电器和机械硬件。1996年，在北约和英国的E-3接受了上述改进后，整个改进计划宣告结束。
