正当莫德尔同其所下辖的军官争论该使用何种方法防御时，莫德尔在6月28日被任命为中央集团军的司令，其因苏军的巴格拉基昂行动而面临被粉碎的命运，苏军在白俄罗斯展开进攻。第9军团(莫德尔以前带过的部队)以及第4军团已掉入苏军的陷阱里，而苏军也已逼近白俄罗斯首都明斯克。尽管局势对德军如此的不利，莫德尔相信他仍然可以守住明斯克，但前提是第4军团必须冲出苏军的包围并回到后方，而增援的部队也是必须的。增援部队必须借由因拉直而缩短的前线取得，因如果前线缩短的话，就不需要那么多的部队防守，剩下的部队就可以增援其他地段，而要拉直前线，位于突出部的部队就必须撤退。然而希特勒禁止第4军团突围，也禁止其他部队撤退，因此莫德尔的计划并没有实现。
明斯克在7月3日被白俄罗斯第1方面军以及白俄罗斯第3方面军攻占，此时莫德尔仍希望可以在明斯克西面重建防线，他开始从北方集团军和北乌克兰集团军中抽调部队以增援中央集团军。然而德军的运输能力不足以承担这一工作，立陶宛首都维尔纽斯以及巴拉诺维奇在7月12日被苏军攻占。同时，乌克兰第1方面军发动利沃夫-桑多梅日攻势以驱逐北乌克兰集团军。德国第1装甲军团尝试以莫德尔的战术守住位于利沃夫东面的防线，不过当德国第4装甲军团被击溃后，第1装甲军团在欠缺支援的情形下不得不后撤。莫德尔获得希特勒允许提供4个装甲师进行支援，且苏军力量耗尽后，在波兰首都华沙郊区挡住苏军的进攻，这允许德军能腾出手来镇压非共产的华沙起义。
诺曼底
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1944年8月17日，由于在重建东部战线的战功，莫德尔获希特勒颁授宝剑橡叶骑士铁十字勋章。同时，他被派往西线，取代冯·克鲁格出任B集团军和西线总司令。当时诺曼底的战线经过近2个月的激烈战斗下崩溃，美国第3军团开向塞纳河，集团军在法莱兹口袋中有被全歼的危险。
莫德尔的第1个命令是守卫法莱兹，这没有令人意外。[9][10] 不过，他很快就改变了主意，说服希特勒授权立即把德国第7军团和艾伯巴赫装甲集群撤走-而这是冯·克鲁格因政治影响力有限，而未能做到的。因此，他能够救出大部份的单位，尽管损失几乎所有的坦克和重型物资。当希特勒要求坚守巴黎时，莫德尔回答他可以这样做，但前提是给予另外200,000人和几个装甲师的增援-一些人形容他的行为幼稚，[11] 和其他人认为他为人精明。援军没有到达，和巴黎在8月25日被解放。同时，莫德尔把部队撤至德国边境。
到9月初，莫德尔感到要同时兼任B集团军和西欧战区总司令的职务变得越来越困难，尤其是面对盟军的空中优势和自己偏爱巡视前线。因此，他很高兴地在该月份把放弃西欧战区总司令的职务交给格特·冯·伦德施泰特。他保留B集团军的指挥权，后直至集团军最后在1945年4月解散。
