第一个牺牲品：“朝鲜甘地”曹晚植
曹晚植(1883年2月1日-1950年10月15日)，号古堂，朝鲜独立运动家，因为其爱国精神赢得了巨大声望，朝鲜人民把他当做最伟大的民族运动旗帜，从此，曹晚植被人称为朝鲜的甘地。1945年8月朝鲜光复后，被选为北朝鲜的临时政府--五道行政局委员会的委员长，金日成被选为副委员长。
曹晚植对共产主义是持坚决反对态度的，对苏联当时在北朝鲜实行的军政统治更是心存不满，在1946年1月4日的五道行政局委员会上被弹劾下台，随即在次日被苏军逮捕。
朝鲜战争爆发后，随着朝鲜人民军的败退，1950年10月中旬，一直被关押软禁的曹晚植被杀害。
党内斗争第一波：金日成清洗北方国内派吴琪燮 朱宁河
北朝鲜劳动党成立前后，国内派在北方的代表人物吴琪燮多次受到抗联派、苏联派在党的会议上的批判，吴琪燮被攻击为“民族主义分子”、“托洛茨基主义左倾分子”。1946年4月16日举行的朝共北朝鲜分局执委会第六次扩大会议上，吴琪爕被苏联派扣上“反苏分子”的帽子，受到降职处分，由朝鲜共产党北朝鲜分局第二书记调任北朝鲜临时人民委员会宣传部长。1948年3月的2次党大会金日成公开处理犯罪者，这次大会上，吴琪爕一派的郑达宁等数名中央委员被革职，这样中央委员中仅剩吴琪爕一人，形如稻草人。直至1956年4月，党的第三次代表大会还仍然安排选举吴琪燮为中央委员，同年5月，又任命其为内阁粮政买卖相(粮食采购销售部部长)。1958年4月吴琪燮被降为平安南道中和郡生产合作协会副委员长，其后，从政坛上消失。
金日成在批判吴琪爕的时候，拉拢吴的部下朱宁河对抗吴琪爕。此后不久朱宁河被批判为“以国内派领袖自居”，犯了“宗派主义和个人英雄主义”错误。1948年8月，他被驱逐出党的核心领导层。9月，朝鲜民主主义人民共和国政府成立，朱宁河任内阁交通相，不久调任朝鲜驻苏联大使，后降为轻工业省属下管理所的负责人。1953年8月，在对国内派原南劳党集团李承烨等的公审记录中，朱宁河被指控为朴宪永——李承烨集团推举的政变政府的副首相人选，因而被撤销中央委员并被开除出党，自此他的政治生涯完全结束。
朝鲜战争全线崩溃时金日成不忘清洗军中延安派武亭
1950年12月21日-23日朝鲜劳动党在北部边境鸭绿江畔的江界举行二届三中全会。金日成发表了长篇讲话，一方面批评了军事将领指挥不力，指责党政军干部的无组织行为。金日成此时急切需要南劳派的全力支持和帮助，因此在批评抗联派、延安派、苏联派的同时，却对朴宪永的亲信--李承烨大加赞扬。
这次全会被批评和受到指责的包括抗联派的金一、崔光、林春秋、苏联派的金烈和延安派的金汉仲、武亭以及国内派的许成泽、朴光熙都名列其中。金日成在紧张状态下对这些官员的批评显得有些急躁。但最后，只有延安派军事骨干武亭中将一人，不仅被撤销中央委员职务，并被永远开除出党。金日成斥责武亭犯有“军阀主义”，指责其应对战争初期的失利承担责任，结果武亭被撤销党中央委员等党内外一切职务。武亭后因病赴中国长春治疗，彭德怀为他安排了当地最好的医院。病危之际他要求返国，经金日成同意，武亭回朝鲜。1953年，他在朝鲜一间军队医院病逝。其后，朝鲜政府为他举行了隆重的丧礼。
