1998年至2002年
1998年的北京“小升初”政策中第一次出现“义务教育阶段公办学校不得招收择校生”的规定。但此时，民办学校以及民办公助学校的招生入学方式开始挑战免试就近入学的原则。出现了公办初中招收“择校生”、高额收取“择校费”、民办学校与公办学校合作招生等现象。
2003年至2007年
北京“小升初”政策变化进入螺旋式循环阶段。2003年，北京市“小升初”政策首次提出坚持以义务教育均衡发展为方向，进一步缩小区域和校际差距。在随后的几年中，“小升初”逐渐形成包括划片就近入学、回户口所在地入学、进入寄宿校(班)、特色实验学校(班)入学、进入办学体制改革试点校和民办学校、特长生入学、特殊教育入学、企事业子弟学校入学、共建生入学以及流动人口子女入学等十余种方式。其中，特长生的比例逐年提高。
2008年至今
市教委将制定“小升初”政策的权力下放到各区县，因此各区县的政策各不相同。到去年，小升初入学方式基本为免试就近入学、对口直升、特长生、推优等。