2000年，民进党执政后，抛出“华侨三等论”，第一等是1949年以后从台湾走出来的华侨；第二等是在台湾念过书的侨生；第三等才是传统华侨、有华人血统的侨民。海外华侨大部分祖籍大陆，民进党独厚“台侨”的做法，引发海外侨胞的不满。绿营执政的八年里，不少传统侨团拒绝与扁“政府”接触，向台当局登记的社团从原本的9000多个减少到4000多个，几乎流失一半多。另外，华侨回台投资，也从2000年的3亿美元，锐减到2008年的2000万美金。这一段时间，也是华埠易帜的高峰期。上世纪末，陈文琪去美国华埠参访时，还能看到很多青天白日满地红旗，到了扁“政府”时代，五星红旗越来越多，旧金山、洛杉矶等地的很多传统华人会馆纷纷改挂五星红旗。
声音 归侨陈文琪：“华埠易帜是大势所趋”
马英九当选台湾领导人后，两岸关系进入新时代。在两岸出现大和解的背景下，侨界出现休兵的呼吁。《美国侨报》曾撰文称，侨界不仅要“求同存异”，更要争取“聚同化异”。不要成为政治势力可以利用、分化的对象。
