陈显达当天还表示，不知道台湾调查人员获准来菲进行联合调查的事情。他说：“我不知道有任何批准的联合调查。(双方)有现行的司法互助协议，他们必须依照外交礼节办事。据我所知，司法部长德利马还不知道这些调查员来了。”在此之前，台湾“中央社”报道说，台湾调查团16日上午抵达马尼拉，菲律宾官方并无人出面接待。台“法务部政务次长”陈明堂16日晚表示，已经与调查团人员联系，双方目前都在台北驻菲经济文化办事处进行技术面协商，调查团“绝非贸然前往”。但《中国时报》网站16日晚间报道称，菲司法部长德利马表示，菲律宾不会与台湾进行联合调查。
“菲律宾海警对5月9日枪击台湾渔民事件的描述就好像是动作电影中的场景：政府执法船在大海上追逐坏人，两艘渔船要撞沉执法船，执法船在危急中躲过碰撞……”《马尼拉公报》16日称，他们通过内部人士拿到了菲海警3页纸的事件报告。报告称，被发现在距离菲班塔延岛39海里处进行“偷渔”活动后，台渔民采取了危险行动试图躲避被抓捕。
菲海警的这一报告与台湾当局的鉴定截然不同。《中国时报》16日称，台“司法部”此前一天正式公布“广大兴28”号渔船遭菲枪击的鉴定报告，报告指出，菲国海巡人员多集中往船员躲藏的机舱扫射，有故意杀人之嫌。而且船身外观没有明显撞击痕迹，因此排除菲国宣称的渔船撞击菲舰船的说法。
