但是，在欢欣鼓舞的同时，应切记保持冷静、清醒的头脑，因为这毕竟只是我国“海洋强国”战略的开局谋篇之作，是海上执法机构改革迈出的第一步，今后仍有很长的路要走，大量后续工作亟待落实。顶层设计要完善，发展规划要拟定，法律法规要修订，机构编制要调整，装备设施要研制，保障措施要跟进，等等。可以说，迫在眉睫的工作不仅很多，而且千头万绪。
众所周知，我国原先的“五龙治海”，多年来由于条块分割、各司其职，存在问题的确不少。但把几个部门的职能职责列在一起，就会发现这是一个极其复杂的“巨系统”。中国海监的职责是巡航监视，查处侵犯海洋权益、违法使用海域、损害海洋环境与资源、破坏海上设施、扰乱海上秩序等违法违规行为;中国渔政则代表国家行使渔政、渔港和渔船检验监督管理权，负责渔船、船员、渔业许可和渔业电信的管理工作，协调处理重大的涉外渔业事件等;公安部边防海警主要负责近海治安，是此前中国唯一的海上武装执法力量;海关总署海上缉私警察的主要职责则是侦查走私犯罪、海上缉私、查处走私违规案件、缉私情报、国际执法合作等。不说别的，下一步要从上述纷繁复杂的内容中，梳理、整合出一套今后中国海警局统一、明晰、规范的职能职责，就绝非易事。它需要对当前海洋现状及维权行动的实时掌握，对机构改革和职能转变的深入掌握，对国内外海洋法律法规的透彻掌握。而如何处理裁撤部门的善后工作等也是改革难点。
