菲律宾之后通过空投向其驻仁爱礁部队提供补给。3月29日，菲律宾再次向仁爱礁派出补给船。虽然菲律宾补给船再次遭到两艘中国海警船拦截，并被命令“停止”所有非法行为，但是补给船以智取胜，借助中国海警船无法通行的浅水区成功突破封锁。此事导致中国外交部发言人指控菲律宾非法占领中国领土。
截至到目前，中菲两国在仁爱礁的对峙局面仍在继续，中国是否会强化其在仁爱礁的军事存在，甚至采取更性侵略性的战术，阻止未来菲律宾的补给努力，仍不得而知。然而，美国总统奥巴马的4月访菲之行，可能会使中国的行为受到约束。
除破中国海警围堵向仁爱礁运送补给之外，菲律宾还于3月30日向联合国仲裁法庭提交了诉状，要求仲裁法庭依据国际法对中菲南海争议进行裁决。菲律宾提交的诉状共10卷，长达4000多页。在补给仁爱礁行动受阻的情况下，菲律宾修改了其原于1月提交的诉状，把仁爱礁也加入其中。尽管中国要求菲律宾放弃仲裁，恢复直接双边对话，但菲律宾曾向联合国仲裁法庭提交了诉状。
在菲律宾提交诉状之前，一位中国外交部发言人公开要求菲律宾“停止不法行为”，退出仲裁程序。发言人还宣布，中方对菲律宾单方面提起并强推仲裁坚持不接受、不参与的立场。
3月30日，中国外交部呼吁菲律宾遵守其对《南中国海各方行为宣言》的承诺，并“回到通过双边谈判磋商解决争议的正确轨道上”。次日，中国外交部召见菲律宾驻华大使埃尔林达-巴西里奥，外交部副部长刘振民就此事向菲方提出“严正交涉”。4月1日，中国驻菲律宾代办发表了一份措辞强硬的声明，称“我们对这种行为的后果深感不安，并会密切关注”。声明还称，菲律宾的行为“严重的破坏双边关系”。
