在体制层面，王芳建议，要建立国家海洋事务高层决策与协调机制，在中共党中央设立海洋工作领导小组，在全国人大设立海洋委员会。国务院则应建立国务院涉海领导小组、涉海部门协商协作机制、执法队伍协作执法机制，协调涉海部门行动。
在王芳看来，国务院设立专司海洋事务的职能部门正当其时。今年两会期间，全国政协常委、原福建省委书记陈明义就提出，应当将国家海洋局升格为正部级的国家海洋部。王芳认为，建立独立且长期稳定的海洋行政机构，符合国际海洋事务发展趋势和规律，符合中国国情。
国防大学科研部原副部长武桂馥也认为，应优化海洋综合管理领导机构的设置，加强统一领导，在国家层面建立海洋开发管理的协调机制，协调中央各相关部门间、中央与地方、军方与地方的涉海工作。
南都记者了解到，相关部门正在就国家海洋局升格为国家海洋部进行调研。
