尽管华盛顿相当不情愿，他还是被推选为第二任总统。不过华盛顿坚持拒绝了担任第三任总统，因此写下美国总统任期不能超过两届的不成文惯例。这个惯例一直到1940年才被罗斯福所打破，但在罗斯福死后这个惯例正式的被写进宪法第22号修正案里面。
华盛顿在他的离职演说成为美国历史上最富影响力的政治演说之一。在演说中他阐述了过份的党派偏见可能对国家造成的不良影响，他呼吁人们抛弃党派之争，团结起来为增进公众利益而努力。他并主张美国应该避免受到他国的干涉，因为美国应该只专注于美国人的利益。他建议与世界上其他国家保持友谊和贸易关系，并应该避免牵扯进欧洲的战争。他认为应该避免与某国家保持长期的同盟关系，并指出应该注意当时美法间的结盟。华盛顿的离职演说成为美国人对政治的准则，尤其对于之后的世代而言，每当发生关于美国的外交政策应该维持中立与否的争论时，华盛顿的演说便成为主张维持中立者最有力的引言，一直到1949年美国开始与其他国家结盟为止。
在约翰·亚当斯的就职典礼上，据说华盛顿还和亚当斯耳语道：“现在我离职了，换你做总统了。让我们等着瞧谁比较喜欢这工作吧!”。华盛顿之后拒绝离开总统办公室，直到副总统—托马斯·杰斐逊也到达，树立了只有正副总统都到齐时才能让出总统职位的惯例。接着，华盛顿步出办公室，回复了平民的身分。
宗教政策方面，美国是建立在宗教自由的基础上的。华盛顿曾宣称：“美国决不是建立在基督教的教条之上。”
退休和去世
两届总统任期届满后，美国人民挽留华盛顿继续竞选连任，华盛顿拒绝了：“我走在尚未踏实的土地上，我的所作所为将可能成为以后历届总统的先例。”他向美国人民解释，“你们再继续选我做总统，美国就没有真正的民主制度了”。
自从1797年3月退休后，华盛顿带着轻松的心情回到弗农山。他在那里建立了蒸馏室，并成为了或许是当时最大的威士忌蒸馏酒制造业者，到了1798年便生产了11,000加仑的威士忌，获得7,500美元的利润。
1799年，美国即将举行总统竞选，联邦党人因为党内分歧和声望日下，希望华盛顿出来竞选，但是华盛顿在致乔纳森·特朗布尔州长的信中拒绝了：“一旦我这样做将是可耻的，因为尽管这是我国同胞的愿望，而且在大家的信任下我可能当选并任职，但另一个比我更有才能的人却会因此去职……如果我参加竞选，我就会成为恶毒攻击和无耻诽谤的靶子，不但会被加上摇摆不定的罪名，而且还会被诬为怀有野心，一遇时机便爆发出来。总之，我将被指责为昏聩无知的老糊涂。”
在那一年里，由于战争逼近，为了警告法国，华盛顿被新总统约翰·亚当斯任命为美国陆军的中将(在当时这是军中最高的阶级了)。这只是象征性的任命，华盛顿并没有真的服役。