有资深科学家以个人名义退出研讨会，有的甚至带走整个研究团队，而越来越多的科研人员也纷纷退出，以示抗议。有科学家担心，受此影响，他们可能无法和中国同行合作，也不能再从中国招募学生。
耶鲁大学天文学教授黛博拉·费舍尔说，中国博士后学生王姬(音译)因为国籍问题而被研讨会拒之门外。直到此时，费舍尔才注意到这项禁令，决定拒绝参加会议，她的整支研究团队也随之退出。
天文学教授杰夫·马西来自加州大学伯克利分校，是诺贝尔奖热门人选。他批评禁令“非常可耻，完全不道德”。在给会议组织者的邮件中，马西写道：“平心而论，我不能参加一个这样带有歧视性的会议。这次会议讨论的问题是万亿英里之外的行星，和国家安全问题没关系。这是纯粹的科学研究，美国把某些国家的人拒之门外，根本不道德。这是道德问题，无法接受。你必须划出一条界限。”
牛津大学天文学家克里斯·林托特呼吁，在解决问题之前完全抵制会议。林托特说：“这项政策的施行方式令我震惊和不安。科学本应是一个对所有人开放的舞台，以国籍为由禁止他人参加违背多年的规矩，一路倒退回冷战时期的俄罗斯和西方科学家的战争会议。开普勒团队应该调整会议地点——在此之前，我呼吁所有人抵制会议。”
