软禁时期
她被多次阻止会见她的政党支持者，并在2000年9月再次被软禁。2002年5月6日，她在一次建立在互信基础上，由联合国主持的秘密协商后被释放。政府发言人说她是由于“我们相信我们可以彼此信任”而重获自由。昂山素姬随后表示这是“国家新的黎明”，然而在2003年5月底，她再次被软禁经历一段时间的关押和9月的一次手术之后，昂山素姬在仰光继续遭到软禁。2004年3月2日，在联合国缅甸事务特使伊斯梅尔的看望下，昂山素姬与缅甸总理钦纽举行了会谈。根据缅甸的法律，逮捕令只允许最多延长五年。2008年5月起已超过拘留期，但她仍然没被释放。2009年3月，联合国任意拘留问题工作组批评缅甸对昂山素姬的拘留已经违背了他自己的法律，并要求立即释放昂山素姬。5月初，一名美国男子耶托游泳潜入昂山素姬仰光湖畔住所，该男子在离开时被军政府发现，对此，军政府指控昂山素季违反软禁令。8月11日，缅甸法庭裁定昂山素姬非法收留美国人罪名成立，再延长18个月软禁。直至2010年11月13日傍晚，昂山素姬终于重获自由。
2010年10月27日晚，缅甸外交部长在河内举行的东盟外长晚餐会上称昂山素季将于11月13日释放。11月13日，缅甸军政府将软禁数年的昂山素姬释放。[15]2010年11月18日下午，中国外交部记者会上，有记者提问：中方是否曾就释放昂山素季对缅甸政府做过工作?发言人洪磊回答：“尊重其他国家根据本国国情选择的发展道路，在和平共处五项原则基础上发展同包括缅甸在内的各国友好关系，是中国政府一贯的政策主张。我们是这么说的，也是这么做的。”
加拿大政府在2007年曾授予昂山素姬荣誉公民的头衔，当时她是世界上第四位获得该荣誉的人士。
2011年至今
11月中旬，昂山表示她和她领导的民主联盟将参加缅甸的议会补选。
2011年12月初，她与到访缅甸的美国国务卿希拉里初次会面。希拉里把奥巴马的一封亲笔信交给了昂山，奥巴马在信中感谢她的斗争激励了全世界的人，美国会永远支持她;希拉里也赞赏和支持昂山的民主斗争。昂山则非常感谢美国对缅甸民主改革事业的支持，两人一致同意继续共同推进缅甸的民主进程。
2012年1月18日，昂山到仰光区选举局登记报名，以竞选角逐靠近仰光的高穆(Kawhmu )村选区的人民院(下院)议席，同年2月6日其参选资格获得选举委员会批准。议会补选将于4月1日举行，人民院共有440个席位，与前军人政府有关的党派占据了其中的绝大多数，这次补选的只有48个席位。
2012年1月底，她离开仰光到海滨城市土瓦等城市，正式为本党党员展开拉票竞选活动，所到之处皆受到民众的热烈欢迎和支持。2月11日，她到她所参选的高穆(Kawhmu)村展开竞选活动。3月8日，她向记者表示此次补选可能会出现舞弊行为，因为官方公布的选民中竟有死人的名字。
