这些农地开发与土地制度，因开启台湾的土地私有制度而引人注目。土地的私有制在当时的中国代表着先进的生产关系。
当时，台湾的少数民族在荷兰殖民者奴役下，生活十分贫困，生产极端落后。郑成功在那里推广了大陆先进的农业生产技术，从此，少数民族也同大陆汉民一样，使用牛耕和铁犁种田。
1662年6月，郑成功病中第二次派人去金厦，命令当地将官杀死郑经等家人，众将为难，最终再次抗命。此前世子郑经无行，种下乱伦的淫果。据清人《闽海纪要》记载：
他又外感风寒，病势日重，但他仍强振余威，登上将台，手持望远镜，远望澎湖，是否有船只到来。文武百官入谒时，他依旧端坐床上，谈论国事。因此，许多官员不知其病。及至他病危时，都督洪秉诚调药送至床前，他将药投地，叹曰：自国家飘零以来，枕戈泣血，十有七年，进退无据，罪案日增，今又屏迹遐荒，遽捐人世，忠孝两亏，死不瞑目，天乎天乎！何使孤臣至于此极也！吾有何面目见先帝于地下。复顿足捶胸，双手抓面，大呼而逝。
就这样，郑成功反清复明的壮志未酬，结束了充满波折的生涯，享年38岁。
他的死因有多种说法，最可信也是最笼统的说法是：郑成功在短短的3个月之内经历了许多让其气塞胸膛怒不可遏的大事：供奉的旗号和精神支柱南明永历帝在云南被吴三桂杀害；降清的父亲叔叔及几位弟弟等族人被清廷斩杀，祖坟被掘；郑经无行，众将抗命……这些负面因素引爆他易怒的个性，加重了他因水土不服所致的病情，最终急怒攻心，含恨而逝。
需要特别指出的一个细节，郑成功收复台湾后，曾派人出使吕宋(今马尼拉)，致函西班牙总督，要求其承认大肆屠杀华人的过错，并要求对方纳贡通行贸易。信函中的言词很强硬，理解成战争檄文也不为过。
