刘志军任铁道部部长期间，王梦恕不止一次与他发生激烈交锋，甚至公开表示，刘志军作风霸道，建设铁路不注重“科学化”。2003年底，甘肃乌鞘岭隧道开工。作为当时最长的铁路隧道，原定工期是4年半，但刘志军要求28个月内贯通，众多专家敢怒不敢言。2004年10月，王梦恕让媒体记者扮成自己的学生前往调查。最终，媒体刊登了《争议“亚洲第一隧道”》的文章，引起重大反响。后来，铁道报的记者采访王梦恕，他直言道：“采访我干什么，我说的话你发得出来吗?”
刘志军被调查后，王梦恕反而不怎么批判他了。“他没倒台的时候，我批评很多;出问题了，我不能落井下石。在高铁发展方面，刘志军还是做了很多有用的事。第一条线路开通后，他敢坐到司机的位置上，一出问题他最先倒霉，所以施工单位也不敢乱来。后来搞不正之风被抓了，那是另外一回事。”
最后，他还不忘教训记者一句：“作为媒体，你们要客观看待这些。”
的确，客观，是一个发言者的尺度，也是听众应该秉持的标准。尤其是当今社会，各种利益纠葛其间，各种面目的代言乱花渐欲迷人眼，更需要单纯且直言的专家。如何断定一个人的发言是否存在私心，不但要看他说了什么，更要看他做了什么，以及给社会带来了什么;不但要看他现在做什么，也要看他过去做了什么、未来会做什么——而时间会给出最客观的评判。