康熙四年(1665年 己巳)
二月 御史董文骥疏言大臣更易先皇帝制度，非是，宜一切复旧。
三月 修缮历代帝王庙。辅政大臣议钦天监官德国传教士汤若望罪。
七月 以太皇太后懿旨，聘辅臣索尼孙女、内大臣噶布喇之女赫舍里氏为皇后，行纳采礼。
九月 册立辅臣索尼之孙女赫舍里氏为皇后。
十月 康熙帝首至南苑校射行围。
康熙五年(1666年 丙午)
正月 辅臣鳌拜与苏克萨哈因换地相争，自此鳌拜专权。
三月 辅臣索尼请皇帝亲政，留中未发。
十一月 辅臣鳌拜以改拨圈地，诬告大学士户部尚书苏纳海、直隶总督朱昌祚、巡抚王登连等罪，逮捕下狱。而辅臣中的索尼年老，遏必隆软弱，苏克萨哈望浅，俱不能抗拒鳌拜。
十二月 鳌拜矫旨杀苏纳海、朱昌祚、王登连。
康熙六年(1667年 丁未)
正月 封世祖第二子皇兄福全为裕亲王。
四月 加索尼一等公。
六月 内弘文院侍读熊赐履上疏，陈述当朝满汉矛盾尖锐、制度废弛。
七月 康熙帝亲政，御太和殿受贺，加恩中外，大赦。始御乾清宫听政。命武职官一体引见。鳌拜杀苏克萨哈及其子。赐遏必隆、鳌拜加一等公。
九月 命修《世祖实录》。康亲王杰书议苏克萨哈罪。
十一月 冬至，祀天于圜丘，奉世祖章皇帝配享。