1999年11月，中美双方就中国加入世贸组织达成协议。同年12月，美国政府同意支付中国政府2800万美元以赔偿中国使馆遭受的损毁，协议同时要求中国付给美国280万美元以赔偿美驻华外交机构的损失。
1999年5月7日，两架美国空军B-2轰炸机从密苏里州的怀特曼空军基地起飞，经过数次空中加油后越过大西洋，在午夜前几分钟飞到南斯拉夫联盟首都贝尔格莱德上空，向一座由美国政府分析员认定的建筑物，发射了5枚2000磅型联合定向攻击炸弹。
中央情报局之所以确定这一目标，是因为它断定这幢建筑将先进的军事技术卖给像利比亚和伊拉克一类的无赖国家，从中获取利润以资助塞族武装。“当真相大白之后，人们发现这一目标实际上是1997年迁入的中国大使馆。这些由美国全球卫星定位系统精确制导的炸弹使该建筑物南侧大部被毁，其中武官处办公室被夷为平地，3名年轻的中国记者丧生，20名中国公民受伤。
炸馆事件在中国引发了自1989年以来最大规模的街头示威活动，也引发了当代中美关系史上最为严重的一次危机。
中方要求：
道歉、解释、严惩肇事者
中国外交部5月8日首次做出正式反应，称炸馆事件为“野蛮暴行”，警告北约须对其后果承担全部责任。外交部副部长王英凡要求召见美国驻华大使尚慕杰，接受中国对美“严重侵犯中国主权”的“最强烈的抗议”。因馆外聚集着示威群众，尚慕杰拒绝离开使馆。
