菲GMA电视台援引匿名菲政府消息源的说法称，协议不允许美国在菲设立常驻基地，也禁止美国在菲部署核武器，但允许美军以“轮换”形式扩大在菲军事存在，部队、战舰、战机均可部署，也可使用菲律宾军事基地。该消息源还称，此协议属于行政协议，因此无需菲国会批准，协议有效期10年。菲律宾德拉萨大学菲美关系专家德尔·卡斯特罗说，“当我们1991年要求美军撤出菲律宾时，无人能想象菲美军事同盟会以这样的方式复活，此协议将改变南海形势，向中国表明：我们在这里盯着你”。
“我们这样做(签署军事协议)不是因为中国，我们这样做是因为这里有我们的长期盟友，他们非常希望增强两军互动”，27日，美国白宫国家安全委员会亚洲事务高级主任麦艾文对美菲军事协议的表态显得与马尼拉略有“温差”。他称赞此协议是数十年来两国签署的最重要协议，但否认华盛顿签署协议的动机是遏制中国崛起。
英国《金融时报》题为“菲律宾寻求美国帮助对抗中国”的文章说，虽然菲律宾拥有亚洲最差的军力，但却是东南亚国家中对抗中国最坚定的一个。已在中国工作20多年的菲律宾记者罗马纳说，菲律宾人觉得中国是恶霸，中国人觉得菲律宾是麻烦制造者，是美国人送到中国周边的特洛伊木马。他还提到，中国1995年“占领美济礁”后，菲律宾人曾发誓决不让此情景重演，但中国人2012年又“占领了黄岩岛”，且美国没有派兵干预，令菲律宾人非常失望。
有了菲美新军事协议，就能挡住中国?《菲律宾星报》15日文章曾分析称，“不能”。文章援引菲学者的话说，中国会将此协议视做挑衅，但不会停止在南海的行动。两名中国国际问题专家27日接受《环球时报》采访，在被问及“美菲新军事协议会对中国产生多大威慑”时分别表示“威慑不大”和“不好说”。中国人民大学国际关系学院副院长金灿荣称，10年前，美国感觉中国海空军都不强，威胁不到美国在第一岛链的驻军，但现在美国感受到中国海空军发展的压力，于是在日韩减少驻军，后撤到关岛和同为第二岛链的菲律宾。他认为，有没有奥巴马访菲，美菲都会签署此协议。中国现代国际关系研究院菲律宾问题专家陈庆鸿说，中国应从两面看待美菲新军事协议，它是美方应对中国军力提升的部署，同时也是对菲律宾的牵制，避免其盲目引发冲突。
